Développement d'une plateforme SHERLOCK pour la détection polyvalente des parasites trypanosomatidés. – SherPa

Nous avons d'abord mis au point une série de tests SHERLOCK in vitro pour détecter et identifier les espèces de trypanosomatidés les plus fréquentes, ainsi que les souches résistantes aux médicaments. À cette fin, nous avons sélectionné et testé différentes cibles géniques afin d'obtenir une spécificité élevée et optimisé certaines étapes clés de la réaction pour accroître la sensibilité des tests.

Ensuite, cet ensemble d'outils a été appliqué à la surveillance éco-épidémiologique de la maladie du sommeil et de la circulation des trypanosomes animaux sur le terrain. Pour ce faire, nous avons analysé des échantillons archivés de sang de patients et des échantillons de sang frais d'animaux domestiques en Guinée, en Côte d'Ivoire et au Cameroun.

Le projet SherPa a permis de développer une nouvelle boîte à outils diagnostiques dont la sensibilité, la spécificité et l'adaptabilité répondent aux critères attendus.

En laboratoire, nous avons identifié et optimisé un ensemble de tests SHERLOCK pour la détection des trypanosomes, destinés à des applications de terrain (Sima et al., EBiomed 2022), notamment pour un diagnostic plus sensible et spécifique de la maladie du sommeil. Nous avons également développé un ensemble de tests SHERLOCK afin d'identifier les souches de parasites résistantes aux médicaments, utilisables en clinique et pour la surveillance épidémiologique (Perez-Anton et al., AAC 2025).

À partir d'échantillons cliniques, nous avons réalisé une analyse quantitative de l'efficacité de l'approche SHERLOCK (sensibilité et spécificité) comme outil de suivi de l'élimination et de la post-élimination de la maladie du sommeil (Sima et al., EBiomed 2022 ; N'Djetchi et al., Infect Dis Pot 2024).

Dans une perspective « Une seule santé », nous avons ensuite fourni une meilleure compréhension de l’importance des réservoirs animaux dans le maintien de la transmission du trypanosome humain et une estimation de la diversité réelle des trypanosomes animaux circulant dans les zones étudiées en Afrique de l’Ouest (Eloiflin et al. eLife 2025).

Au total, SherPa a fourni une nouvelle méthode de détection SHERLOCK rentable et adaptable sur le terrain pour le diagnostic très sensible et spécifique des maladies tropicales négligées causées par des parasites trypanosomes, en mettant l'accent sur le diagnostic de la maladie du sommeil pendant les phases d'élimination et de post-élimination.

Nous travaillons aujourd'hui à développer une version du test pour le diagnostic rapide individuel de la maladie du sommeil directement dans les postes de santé. Et nous élargissement la boite à outil SherPa pour dépister la maladie de Chagas et les leishmanioses.

Les maladies tropicales négligées causées par les parasites trypanosomatidés - trypanosomoses africaines, maladie de Chagas et leishmanioses - affectent à la fois les humains et les animaux, et constituent un fardeau économique majeur pour les populations les plus pauvres. La progression vers leur contrôle ou leur élimination dépend d'une surveillance précise par des tests fiables. SherPa est un projet translationnel multidisciplinaire original qui vise à : (WP1) développer des outils de détection hautement sensibles et spécifiques basés sur la méthode SHERLOCK, pour le diagnostic actif ou passif rapide de ces infections à trypanosomatidés et la détermination des résistances aux traitements, et (WP2) démontrer l’efficacité de ces nouveaux outils en menant des études épidémiologiques sur les trypanosomoses africaines en Afrique de l’Ouest afin d'étudier l'impact des programmes de lutte sur la circulation parasitaire et de déterminer la diversité des hôtes réservoirs dans ces régions.