Comment les animaux génèrent et régénèrent la diversité cellulaire: approche intégrative d’imagerie en direct, traçage cellulaire, intelligence artificielle et visualisation – DeepLineage
Comment les animaux génèrent et régénèrent la diversité cellulaire
Une approche intégrative d’imagerie en direct pour le traçage et la visualisation des lignées cellulaires
Les organismes multicellulaires sont constitués d'une grande diversité de cellules, générées au cours du développement. La généalogie des cellules joue un rôle déterminant pour leur destin et plasticité. Certains animaux peuvent également régénérer leur corps à l’âge adulte, à partir de cellules progénitrices dont les propriétés sont largement inconnues. Notre objectif est de développer un cadre généralisé pour l’analyse des lignées cellulaires, afin de révéler comment la généalogie des cellules influence leur destin pendant le développement et la régénération.
Sur le plan expérimental, nous avons développé des outils génétiques pour visualiser la diversité et la differentiation cellulaire au cours du développement embryonnaire et de la régénération, et des approches d'imagerie en direct pour suivre des lignées cellulaires, focalisés sur le crustacé Parhyale hawaiensis, un modèle expérimental où la régénération se produit avec une fidélité exceptionnelle. Sur le plan informatique, nous avons développé une plateforme intégrée pour le traçage, la visualization et l'analyse des généalogies cellulaires, qui réponds plus largement aux besoins de la communauté de recherche en biologie du développement.
Les organismes multicellulaires sont constitués d'une grande diversité de cellules, générées au cours du développement. La généalogie des cellules joue un rôle déterminant pour leur destin et plasticité. Certains animaux peuvent également régénérer leur corps à l’âge adulte, à partir de cellules progénitrices dont les propriétés sont largement inconnues. Notre objectif est de développer un cadre généralisé pour l’analyse des lignées cellulaires, afin de révéler comment la généalogie des cellules influence leur destin pendant le développement et la régénération. Sur le plan expérimental, nous développerons des approches de génétique et d'imagerie en direct pour suivre des lignées cellulaires, focalisées sur le crustacé Parhyale hawaiensis, un modèle expérimental où la régénération se produit avec une fidélité exceptionnelle. Sur le plan informatique, nous développerons un cadre intégré pour le traçage (utilisant l'intelligence artificielle), la visualization et l'analyse des lignées cellulaires.
Coordination du projet
Michalis Averof (INSTITUT DE GENOMIQUE FONCTIONNELLE DE LYON)
L'auteur de ce résumé est le coordinateur du projet, qui est responsable du contenu de ce résumé. L'ANR décline par conséquent toute responsabilité quant à son contenu.
Partenariat
IGFL INSTITUT DE GENOMIQUE FONCTIONNELLE DE LYON
University of Technology, TU Dresden / DFG Cluster of Excellence 'Physics of Life'
Max Planck Society / Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (MPI-CBG)
Aide de l'ANR 399 836 euros
Début et durée du projet scientifique :
décembre 2021
- 36 Mois