Précision de la transcription au cours du développement : le problème des gènes emboités. – TransDev

Au cours du développement, pour que la spécification cellulaire soit robuste, la transcription des gènes doit être précise. Cependant plusieurs topologies génomiques posent problème, comme la configuration emboitée opposée où un gène est localisé dans l’intron d’un gène hote en direction opposée. Nous allons caractériser comment cette configuration spécifique affecte la variabilité et la précision de l’expression génique au cours du développement, en utilisant l’embryon de C. elegans, qui permet une quantification précise de l’expression des gènes en résolution cellule unique. Nous utiliseront une combinaison d’ingénierie du génome par CRISPR, de détection d'ARN en molécule unique, d’imagerie de la transcription in vivo et d’ARN-seq cellule unique. Cette intrigante configuration génique étant fréquente chez les animaux, dont l’homme, et impliquant des gènes développementaux, notre étude aura un large impact sur la compréhension de la précision transcriptionnelle au cours du développement.