Mécanisme d'invasion des nucléosomes par la famille de facteurs de transcription pionnier Sox – SIMOS

Les facteurs de transcription pionniers Sox sont caractérisés par un domaine HMG de liaison à l'ADN qui reconnaît un motif TTGT. Sox se lie à l'ADN en élargissant le petit sillon et en induisant une forte courbure de l'ADN. Des structures Cryo-EM récentes ont montré que Sox était capable de former un complexe avec le nucléosome. Cependant, on ne sait pas comment Sox envahit et déstabilise le nucléosome. Nous proposons de disséquer le mécanisme de la liaison de Sox au nucléosome et d'analyser les propriétés d'invasion de la chromatine par Sox en combinant des approches computationnelles, structurales, biophysiques, biochimiques et cellulaires. Nos données préliminaires suggèrent que la liaison de Sox est déterminée à la fois par les fluctuations thermiques locales et la pliabilité de l'ADN nucléosomique. Ce travail devrait permettre de comprendre comment Sox envahit les nucléosomes et facilite l’action des facteurs de remodelage de la chromatine.