Préparation et intervention d'urgence lors d'émergences de pathogènes d’intérêt médical et/ou vétérinaire – PREPMedVet

Les progrès rapides des technologies de séquençage et de bioinformatique, accompagnés d’une réduction drastique
des coûts de séquençage, ont révolutionné la génomique microbienne et fourni un aperçu sans précédent sur
l’évolution microbienne, la diversité et l’interaction hôte-pathogène. De plus, les technologies génomiques ont
démontré un grand potentiel et de la pertinence pour un diagnostic étiologique en temps réel dans un contexte clinique et
la surveillance des épidémies. L’objectif général des partenaires PREPMedVet (FLI, BNITM, ANSES et AMU)
est de mettre en place une plateforme de séquençage et diagnostic portable capable de livrer dans un contexte cliniquement pertinent
des informations critiques au premiers temps d'une situation épidémique. Le consortium a pour objectif de
développer un protocole standard qui pourrait être appliqué sur site à l’aide de plateformes de séquençage portables de nouvelle génération (type Minion ou autre) et de suite logiciels d’analyse de séquence capables de fournir, a des utilisateurs non spécialistes des informations pertinentes pour comprendre les modes de transmission des agents infectieux, la génomique des agents pathogènes, l’évolution et l’origine possible de ces agents infectieux. L’identification des agents pathogènes s’accompagnera de la production et de la validation de tests de détection faciles à utiliser; tests de détection qui pourront être aisément stockés, transportés et livrés aux utilisateurs finaux pour une utilisation facile selon les scénarios d'épidémie possibles. Le projet PREPMedVet regroupe des partenaires français et allemands pertinents à la fois dans le domaine de la santé humaine et animale dans une approche One Health et associe aussi des utilisateurs finaux, acteurs de terrain en cas de crise.