Système de tri microfluidique pour la bioprospection de nouveaux antibiotiques – DEINODROP

Les antibiotiques jouent un rôle majeur dans la médecine moderne, mais la résistance devient une menace majeure. L'objectif de ce projet est de développer une technologie de pointe utilisant la microfluidique en gouttelettes pour le criblage des micro-organismes environnementaux pour leur capacité à produire de nouveaux antibiotiques. Nous utiliserons des souches rapporteuses avec des gènes rapporteurs sous le contrôle de promoteurs induits par le stress pour sélectionner des millions de micro-organismes par jour. La nouveauté du métabolite secondaire responsable de l'activité de l'antibiotique dans la gouttelette sera évaluée par spectrométrie de masse et la cellule triée responsable de sa production sera séquencée par séquençage du génome entier de cette cellule. Le groupe de gènes biosynthétiques produisant ce métabolite sera identifié, cloné dans des BAC et exprimé dans un châssis bactérien pour une expression hétérologue.