Environnement en crèche, microbiote nasal et santé respiratoire de jeunes enfants – CRESMINA

L’étude est basée sur la cohorte CRESPI (Santé Respiratoire des enfants en Crèche, (https://crespi.vjf.inserm.fr/), initiée en janvier 2019 (financement ANSES-CRESPINET) et qui prévoit l’inclusion de 1500 à 2000 enfants fréquentant des crèches franciliennes, avec une caractérisation détaillée des expositions chimiques en crèche. Le projet CRESMINA est conduit à partir du sous-échantillon des enfants de moins d’un an à l’inclusion (n~800). Nous allons : caractériser le microbiote nasal des enfants via des prélèvements nasaux avant 12 mois puis à 24 mois ; améliorer la caractérisation de l’environnement en crèche en mesurant le microbiote dans les poussières ; et améliorer l’évaluation de la santé respiratoire par un suivi jusqu’à l’âge de 4 ans. La composition des microbiotes nasal et environnemental sera évaluée par séquençage du gène de l'ARNr 16S. Les analyses statistiques pour les objectifs 1 à 3 comprennent l’identification de profils de microbiote (transversaux/longitudinaux) et de phénotypes de sifflements (longitudinaux) par des méthodes de clustering, des régressions logistiques multinomiales avec ajustement sur l’ensemble des facteurs de confusion potentiels, et l’utilisation de méthodes récentes (modèles marginaux structuraux) pour les analyses de médiation, basées sur des approches d’inférence causale.

L’étude CRESPI a débuté en novembre 2019 et le recrutement des participants est en cours. Les méthodes mises en œuvre pour la caractérisation du microbiote des poussières déposées dans les crèches et la caractérisation du microbiote nasal ont confirmé la bonne faisabilité du projet CRESMINA.

Le projet permettra d’identifier des profils spécifiques de microbiote nasal associés différentiellement à des déterminants précoces de l’asthme et à la santé respiratoire ; et de comprendre leur rôle potentiel comme médiateur/modulateur. Cette connaissance pourrait s’avérer essentielle pour développer des stratégies de prévention ciblées.

Le projet n'a pas encore donné lieu à des publications scientifiques

L’asthme est une maladie respiratoire chronique fréquente, associée à une morbidité importante à long terme. Le rôle essentiel des expositions précoces dans les origines de l’asthme est largement reconnu. Les expositions microbiennes et chimiques sont des facteurs de risque importants pour l’asthme chez les jeunes enfants, mais les connaissances actuelles n’ont pas permis d’établir de stratégie de prévention efficace. Le développement récent d’approches de séquençage haut-débit pour caractériser les microbiotes humains et environnementaux a renforcé les preuves d’un rôle des communautés microbiennes dans l’asthme. Ces recherches émergentes offrent des opportunités uniques pour mieux comprendre les mécanismes d’action de l’environnement précoce sur la maladie. Cependant, il est nécessaire de conduire de vastes études prospectives avec une évaluation répétée du microbiote respiratoire dans les premières années de vie pour clarifier (1) le rôle exact de profils spécifiques de microbiote respiratoire et leur évolution dans le développement de l’asthme ; (2) l’impact de facteurs de risques modifiables de l’environnement précoce sur le microbiote respiratoire ; et (3) un rôle potentiel du microbiote respiratoire comme médiateur ou modulateur dans la relation environnement-asthme.
Le projet CRESMINA porte sur les crèches, un environnement où beaucoup de jeunes enfants passent une grande partie du temps, et qui pourrait impacter le risque d’asthme. L’objectif principal est d’étudier les relations entre l’environnement en crèche, le microbiote nasal, et la santé respiratoire des jeunes enfants, avec 3 objectifs spécifiques : (1) déterminer les associations entre les expositions en crèche et les profils de microbiote nasal (évalués de façon transversale et longitudinale), pour les expositions suivantes : nombre/caractéristiques des occupants, microbiote environnemental (poussières), expositions chimiques dans l’air intérieur, et pratiques de nettoyage/désinfection ; (2) déterminer les associations entre les profils de microbiote nasal avec la santé respiratoire (phénotypes de sifflements évalués de façon longitudinale) ; et (3) évaluer le rôle médiateur et/ou modulateur du microbiote nasal dans l’association entre les expositions en crèche et la santé respiratoire.
L’étude sera basée sur la cohorte CRESPI (Santé Respiratoire des enfants en Crèche), qui sera initiée en janvier 2019 (financement ANSES-CRESPINET) et prévoit l’inclusion de 2000 enfants fréquentant des crèches franciliennes, avec une caractérisation détaillée des expositions chimiques en crèche. Le projet CRESMINA sera conduit à partir du sous-échantillon des enfants de moins d’un an à l’inclusion (n~800). Nous allons : caractériser le microbiote nasal des enfants via des prélèvements nasaux avant 12 mois puis à 24 mois ; améliorer la caractérisation de l’environnement en crèche en mesurant le micobiote dans les poussières ; et améliorer l’évaluation de la santé respiratoire par un suivi jusqu’à l’âge de 4 ans. La composition des microbiotes nasal et environnemental sera évaluée par séquençage du gène de l'ARNr 16S. Les analyses statistiques pour les objectifs 1 à 3 comprennent l’identification de profils de microbiote (transversaux/longitudinaux) et de phénotypes de sifflements (longitudinaux) par des méthodes de clustering, des régressions logistiques multinomiales avec ajustement sur l’ensemble des facteurs de confusion potentiels, et l’utilisation de méthodes récentes (modèles marginaux structuraux) pour les analyses de médiation, basées sur des approches d’inférence causale.
En résumé, le projet permettra d’identifier des profils spécifiques de microbiote nasal associés différentiellement à des déterminants précoces de l’asthme et à la santé respiratoire ; et de comprendre leur rôle potentiel comme médiateur/modulateur. Cette connaissance pourrait s’avérer essentielle pour développer des stratégies de prévention ciblées.