Complexité génomique de l’holobionte « corail » à l’échelle du Pacifique – CORALGENE

Bien que représentant ~0.2% de la surface des océans, les récifs coralliens abritent ~25% de la biodiversité marine and procurent de la nourriture à presque 1 milliard de personnes. Les services écosystémiques issus des récifs coralliens sont essentiels, à travers les pêcheries, le tourisme et la protection côtière et sont estimés à environ 30 milliards de dollars par an. Mais les coraux subissent des stress et les estimations récentes indiquent que ~20% des récifs ont disparus, ~25% sont en danger et ~25% de plus seront menacés à l’horizon 2050. Les récifs coralliens ont souvent été sur le devant de la recherche sur le changement climatique, en raison des blanchissements coralliens, de l’acidification des océans et des préoccupations liées aux crises de croissance des récifs. Les derniers développements génomiques ont permis de révéler que la complexité du génome des coraux est similaire à celle des vertébrés. A cette complexité vient s’ajouter celle de la photo-symbiose obligatoire des coraux avec des microalgues. Les conséquences physiologiques de la présence de ces algues photosynthétiques et les impacts physio-génomiques profonds résultants de cette symbiose sur les deux partenaires, restent encore à être pleinement élucidés. Au delà de cette symbiose, les coraux hébergent également un ensemble de bactéries et virus largement inconnus à ce jour, formant un symbiocosme complexe appelé holobionte qui l’inscrit dans la révolution actuelle de l’étude générale du microbiome dans le monde animal. Le projet intitulé “ Complexité génomique de l’holobionte « corail » à l’échelle du Pacifique ” est particulièrement ambitieux dans la mesure où il s’attachera à étudier la complexité de la diversité de l’holobionte « corail » dans le contexte actuel des récentes mortalités dramatiques du corail suite aux blanchissements. Le projet CORALGENE s’appuie sur la nouvelle expédition Tara, Tara-Pacific (2016-2018), ainsi que sur l’expérience de l’expédition précédente, Tara-Oceans, et va se consacrer aux récifs coralliens à travers l’océan Pacifique. Un transect est-ouest du Panama jusqu’au Japon et sud-nord de la Nouvelle-Zélande jusqu’au Japon sera réalisé en échantillonnant 3 espèces de coraux, un poisson et l’eau environnante, sous le concept d’un mini-écosystème dans près de 35 systèmes insulaires. CORALGENE va permettre le développement et l’application de technologies de séquençage nouvelle génération à la pointe afin de révéler toute la diversité microbienne impliquée dans l’holobionte corail. CORALGENE rassemble un consortium d’experts internationaux en biologie et écologie marines, biologie moléculaire et cellulaire, génomique et bioinformatique pour établir un inventaire morpho-moléculaire exhaustif de la diversité de l’holobionte corail, des virus jusqu’aux procaryotes, eucaryotes unicellulaires et métazoaires, en incluant toute la biodiversité de l’eau interstitielle et ambiante. Ce projet associé à une grande expédition scientifique très ambitieuse va révéler une toute une nouvelle diversité microbienne, mais aussi mettre à jour les liens complexes entre les génomes, les transcriptomes, les métabolomes, les organismes et le fonctionnement des écosystèmes récifaux et va représenter une référence sur l’état biologique des récifs modernes pour la communauté scientifique internationale s’intéressant à l’adaptation des coraux aux stress globaux et régionaux.