Etude à grande échelle des génomes des mycoplasmes de ruminants : évolution et adaptation de bactéries minimales à des hôtes complexes – EVOLMYCO

Les mycoplasmes sont des bactéries minimales, connues comme des agents infectant une large gamme d'hôtes. Jusqu'à présent, on pensait qu'ils avaient évolué à partir du phylum des firmicutes uniquement par perte de gènes. Nos résultats remettent en cause ce dogme car un degré élevé de transfert latéral entre mycoplasmes qui infectent des ruminants a été trouvé. Les gènes impliqués sont supposés jouer un rôle dans les interactions avec l'hôte, voire dans le pouvoir pathogène. Dans ce projet, nous proposons de séquencer 20 génomes de mycoplasmes de ruminants en choisissant de nouvelles espèces mais aussi des souches pour lesquelles un génome de référence est disponible. Des analyses de génomique comparée permettront d'identifier les jeux de gènes qui sont spécifiques de groupes d'espèces ou de souches. Les gènes qui ont été transférés latéralement seront identifiés et le contenu en gènes de l'ancêtre de groupes d'espèces apparentées sera déterminé. Enfin, en incluant des mycoplasmes qui différent par leur spécificité d'hôtes (petits/grands ruminants) ou par leur virulence nous projetons d'identifier les gènes qui sont les supports de ces propriétés.