– FLAVORES

Ce projet a pour ambition d’explorer, chez la truite arc-en-ciel, les bases génétiques et fonctionnelles de la résistance à Flavobacterium psychrophilum, une bactérie qui provoque des mortalités importantes dans les élevages de salmonidés. Il associe des généticiens, des bactériologistes et des immunologistes. En s’appuyant sur un matériel génétique original (des lignées homozygotes de truite de résistance opposée), il étudiera les mécanismes de défense et les gènes impliqués dans la réponse de l’hôte à l’infection, et fournira une description moléculaire et quantitative de la variabilité génétique de la résistance observée chez l’hôte. Il combinera l’analyse de caractéristiques de la réponse immunitaire innée, des études d’expression (transcriptome, gènes candidats), la description de la structure et du polymorphisme des gènes du CMH et la recherche de QTL de la résistance. Il apportera des connaissances nouvelles sur la génétique de la résistance de la truite, connaissances qui seront utiles pour la définition de futures stratégies de contrôle de la maladie, qu’il s’agisse du développement de vaccins efficaces ou de la mise en place de schémas de sélection exploitant les résistances naturelles de la truite.