– DELISUS

Le projet DéLiSus est un projet intégré ayant pour but l'étude de la variabilité haplotypique du genome porcin à haute densité (1 SNP / 500 kb sur l'ensemble du génome, 1 SNP / 100 kb sur 10 % du génome). Les principales races francaises, et les races synthétiques dérivées détenues par les sélectionneurs de BIOPORC seront étudiées. Les animaux des races principales seront phénotypés au sein de la station de contrôle du Rheu. Outre les paramètres zootechniques détaillés et une analyse metabolomique du sérum, une mesure de paramètres de la réponse immune sera réalisée sur certains animaux.
L'analyse des hapotypes permettra une analyse très détaillée de la diversité génétique des principales races françaises et la détection de traces de sélection révélant des régions ayant répondu à la sélection. Une analyse d'association sera réalisée pour estimer les effets des haplotypes sur les différents caractères mesurés.

Le projet inclura également la détection in silico de SNP à partir des séquences disponibles (notamment 1 million de séquences réalisées au CNS), le stockage et la gestion des données dans le système d'information de SIGENAE