Epizooties introduites par la faune sauvage: risques associés aux Influenza aviaires – MIGRAVFLU

Certaines maladies transmissibles sont actuellement en émergence. C’est le cas des virus Influenza aviaires hautement pathogènes responsables d’épizooties et parfois d’infections chez l’homme. Depuis 1999, plusieurs souches hautement pathogènes ont touché l’Union Européenne, en particulier la souche H5N1 en 2006, et ont été responsables de pertes très importantes pour l’économie avicole. Ces évènements récents ont conduit les pouvoirs publics à s’interroger sur le rôle des oiseaux sauvages dans l’épidémiologie de ces risques. L’avifaune sauvage représente l’élément central de l’écologie des virus Influenza A. La France est un carrefour pour les oiseaux migrateurs de la zone paléarctique et est donc un lieu potentiel privilégié pour l’échange et le réassortiment de sous-types d’Influenza. Cependant les connaissances sur la circulation des Influenza aviaires restent encore fragmentaires. Ce projet se propose de réunir des scientifiques issus de la virologie, l’ornithologie, l’écologie évolutive, la génétique de la réponse immunitaire, la médecine vétérinaire et la modélisation afin d’éclaircir le rôle de la faune sauvage sur la dynamique des virus Influenza A. Ce projet est composé de plusieurs sous-projets complémentaires qui permettront de caractériser les diversités génétiques des sous-types de virus Influenza A dans la faune sauvage et les cinétiques de leurs distributions spatio-temporelles ; la dispersion des oiseaux sauvages et les conséquences sur les dynamiques des flux viraux ; les relations phylogénétiques entre variants viraux ; les régions du génome impliquées dans la réponse immunitaire ; les paramètres écologiques et génétiques favorisant l'évolution de sous-types. L’ensemble de ces données sera intégré pour modéliser les dynamiques spatiales et temporelles des virus de la grippe aviaire, à l'aide de la simulation multi-agents. L‘ensemble de ces résultats aidera à la prédiction et l’anticipation de risques pour l'économie avicole et la santé humaine.