Caractérisation Immuno-virologique de l¿infection à Chikungunya – CHIKIMMOVIR

L'épidémie actuelle de Chikungunya (CHIKV) à La Réunion et les îles avoisinantes posent un nombre majeur de questions devant le faible niveau de connaissances virologiques mais surtout immunologique disponibles. Les souches virales en circulation ne sont que partiellement séquencées et leur phylogénie et leur variabilité restent à définir, en relation avec l'expression pathologique actuelle, fréquemment compliquée de cas sévères. Cette infection habituellement très aigue et bénigne peut revêtir plusieurs formes avec passage à la chronicité, manifestations tissulaires ou rechutes suggérant qu'un seul virus ou ses variantes peuvent induire diverses formes de réponses immunitaires aigues ou chroniques. L'immunité native (cellules NK et dendritiques) pourrait dans les premiers jours contrôler l'infection mais n'a jamais été explorée, relayée par l'immunité adaptative T puis anticorps dont le niveau de connaissances est nul pour les cellules T, très limité pour les anticorps. Un vaccin prot...
Le projet intègre des chercheurs de la Réunion responsables de la prise en charge du Chikungunya sur place , un centre de référence associé des arboviroses, et une IFR spécialisée dans l'immunité anti-infectieuse. Il est complémentaire d'une demande de financement (PHRC) explorant les aspects médicaux de l'infection, dont il diffère par une approche plus fondamentale. Le projet est rendu possible par un recueil d'échantillons précis selon des procédures validées dont un accord a été obtenu auprès du CCPPRB et déjà démarré avant que l'épidémie ne décline. Une collaboration étroite aura lieu entre les différentes équipes avec transferts d'informations et d'échantillons (selon les lois en vigueur pour le transports) et transferts de technologie. Le projet vise à :
- définir les séquences virales, leur phylogénie et leur variabilité en relation avec l'expression clinique et tissulaire de la maladie.
- Définir les paramètres de l'immunité innée mis en place dès les premiers jours de l'infection et susceptibles d'exercer un contrôle immun puissant :
o les cellules NK dont l'exploration portera essentiellement sur leur état d'activation, leur expression des divers récepteurs inhibiteurs et activateurs et leur fonction : travail réalisé en partie à l'Hôpital (CHD) et l'Université (LGBM) de la Réunion pour les aspects phénotypiques et à l'IFR 113 pour les aspects fonctionnels
o les cellules dendritiques et en particulier leur capacité à produire en présence de CHIKV l'interféron 'alpha, susceptible de participer de façon puissante au contrôle immédiat de l'infection et coordonnant la mise en place de l'immunité adaptative : ce travail sera réalisé à l'Université de la Réunion en collaboration avec l'IFR113
o les facteurs solubles connus ou non détectés par un criblage systématique par protéomique à l'IFR113 à partir d'échantillons préparés et stockés au CHD
- Définir les paramètres de l'Immunité adaptative en relation avec les séquences virales identifiées, à l'IF(...?)
Ce projet permettra de mieux comprendre les relations hôte-virus dans le cadre de l'infection à chikungunya, apportant à la fois des connaissances critiques pour la prise en charge de cette épidémie et de cette infection, mais également considérée comme modèle d'étude des arboviroses aigues symptomatiques à évolution épidémique. Ce projet apportera des informations spécifiques sur :
- les séquences virales , leur phylogénie et le rôle de la variabilité dans l'expression clinique, critiques pour la compréhension et la gestion clinique et thérapeutique de cette maladie ainsi que pour la définition de stratégies vaccinales rationnelles
- l'immunité innée et adaptative mise en jeu par cette infection dans ces diverses formes cliniques et la définition des cibles antigéniques des réponses spécifiques, qui complèteront les informations virologiques pour la définition des mécanismes