– SNPEA

Les légumineuses à grosses graines produites en Europe constituent une matière première de qualité pour l'alimentation animale; elles pourraient remplacer partiellement le soja importé. Le pois est la plus représentative de ces légumineuses, mais le développement de cette culture reste limité du fait de rendements instables. L'utilisation de variétés d'hiver permettraient d'améliorer la productivité et la stabilité du rendement du pois, mais il est pour cela nécessaire de créer des variétés qui surmontent les 2 principaux facteurs limitants du contexte hiver, c'est-à-dire le gel et les maladies (anthracnose et Aphanomyces euteiches). Les résistances correspondantes sont des caractères quantitatifs pour lesquelles la sélection sur phénotype est très coûteuse; le défi de la recherche est d'identifier des marqueurs moléculaires associés à des gènes de résistance qui faciliteraient le travail de sélection. Des résultats récents de cartographie de QTLs ont fourni une vue d'ensemble des principales régions du génôme du pois impliquées dans la résistance aux stress hivernaux. Il est maintenant judicieux de valoriser les séquences différentiellement exprimées en conditions de stress, produites dans le cadre des précédents programmes Génoplante Pois, afin d'entreprendre une approche gènes candidats. Nous proposons dans le cadre de ce projet de valider l'implication potentielle de gènes candidats stress hivernaux dans le déterminisme des résistances au gel et aux maladies par (i) une action de cartographie des ESTs qui permettra d'identifier les séquences sous-jacentes aux QTLs de résistance, (ii) une étude de génétique d'association qui permettra d'analyser les corrélations entre les variations alléliques aux séquences d'intérêt et les variations quantitatives des résistances étudiées (iii) et finalement de caractériser des variations alléliques aux gènes candidats en évaluant le phénotype de mutants de TILLING. Les résultats attendus sont : (i) la cartographie génétique de 150 marqueurs dérivés d'EST et confirmés par Q-RT-PCR, (ii) l'identification par ECOTILLING et le séquençage des haplotypes correspondants à 40 ESTs colocalisant avec des QTLs, ce qui permettra le développement de 15-20 marqueurs SNP (iii) et finalement la production de mutants de TILLING pour 10 loci de gènes candidats.