Nouvelles connaissances sur les écosystèmes microbiens des sources hydrothermales profondes – HOTDOG

L'étude des écosystèmes des cheminées hydrothermales profondes, qui sont parmi les écosystèmes microbiens les plus intrigants et les moins étudiés sur Terre, pourrait offrir des opportunités uniques d'accéder à des connaissances fondamentales sur leur biodiversité et leur dynamique, tout en permettant de mieux comprendre comment la vie repousse ses frontières dans les environnements profonds. L'objectif du projet HOT DOG concerne l'acquisition de connaissances fondamentales sur la biodiversité procaryotique et la dynamique des écosystèmes hydrothermaux. Ceci sera réalisé grâce à des approches couplées sur site et au laboratoire impliquant la microbiologie haute pression, l'échantillonnage environnemental, l'instrumentation miniaturisée pressurisée à criblage rapide, des outils transparents avancés pour la caractérisation in situ, des plateformes de bioréacteurs et la modélisation numérique. Nous considérerons spécifiquement l'environnement des cheminées et des panaches proches exposés à des température allant de 20 à 135°C, donc les souches méso-, thermo- et hyper-thermophiles. L'objectif est de combler le fossé entre les données basées sur les séquences et les données physiologiques et biochimiques en proposant de nouvelles méthodologies pour isoler et cultiver une grande diversité de microorganismes habitant les écosystèmes hydrothermaux. Nos objectifs spécifiques comprennent : (i) l'identification et l'isolement de nouveaux microorganismes des sources hydrothermales par des approches d'échantillonnage et de culture sans décompression , (ii) le phénotypage des microbes des sources hydrothermales grâce à des approches microfluidiques HP / HT pour déterminer les frontières de la vie, (iii) l'étude des stratégies d'interaction de colonisation des microbes des cheminées des sources hydrothermales dans des environnements poreux confinés et (iv) l'évaluation de l'utilisation des microbes des sources hydrothermales dans les bioprocédés haute pression.