CE45 - Mathématiques et sciences du numérique pour la biologie et la santé

Exploration, Visualisation et Modélisation Computationnelle des Réseaux de Signalisation Redox – MinOmics

Résumé de soumission

Ce projet a pour but le développement de MinOmics, une chaîne de traitement d'analyse et de visualisation dédiée à l’analyse multi-omique et utilisé comme cas d’étude pour l’exploration des réseaux de signalisation redox. Nous proposons une méthode d’analyse visuelle et interactive des résultats et analyses biologiques sur un mur de visualisation de 8.3m2 et d’une résolution de 25 MPixels. La modélisation des réseaux redox sera basée sur des approches mathématiques originales pour réduire le nombre de paramètres à estimer. L'interprétation structurale sera menée à travers un pipeline de modélisation pour la prédiction des sites de modification. La modélisation permettra de révéler les déterminants structuraux des modifications redox et d’étudier la dynamique du réseau ouvrant ainsi des perspectives et champs d’études indispensables en agriculture, biotechnologie et en médecine. Ce projet intègre les plus récentes technologies de modélisation dans le contexte de la biologie intégrative.

Coordinateur du projet

Monsieur Stéphane LEMAIRE (Laboratoire de Biologie Computationnelle et Quantitative)

L'auteur de ce résumé est le coordinateur du projet, qui est responsable du contenu de ce résumé. L'ANR décline par conséquent toute responsabilité quant à son contenu.

Partenaire

LBMCE Biologie moléculaire et cellulaire des eucaryotes
LBT Laboratoire de Biochimie Théorique
IJM Institut Jacques Monod
I2BC Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
LCQB Laboratoire de Biologie Computationnelle et Quantitative

Aide de l'ANR 770 063 euros
Début et durée du projet scientifique : mars 2020 - 48 Mois

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