Implication des communautés bactériennes dans l'état de vulnérabilité des sols sahéliens : approches biologiques, physicochimiques et sociales – SOLAO

L’enjeu du projet « SolAO » consiste à aborder la question fondamentale de la vulnérabilité des sols sahéliens d’Afrique de l’Ouest soumis aux effets des changements climatiques (sécheresse, augmentation de la température) et anthropiques (sur-exploitation des terres liée à l'intensification des cultures et de l'élevage, modification des pratiques culturales par les paysans en réponse à l'évolution de l'environnement), en considérant la composante bactérienne des sols pour en définir des indicateurs populationnels et fonctionnels de l’état de vulnérabilité des sols. Ces buts nécessiteront le développement et l’application des toutes dernières technologies de génomique microbienne environnementale basées sur la détermination de la composition de la communauté bactérienne par hybridation de l’ADN extrait du sol sur puces à ADN de type taxonomique et la détection de gènes d’adaptation par création et criblage de banques d’ADN métagénomique et séquençage massif par des techniques à haut débit. Ces travaux réalisés sur des échantillons de sols prélevés dans des conditions contrastées d’environnement (zones de pluviométries différentes, sols de surface et de profondeur) et de pratiques culturales (parcelles témoins et parcelles en défens, variétés végétales présentant différents niveaux d’adaptation aux conditions de milieu) seront doublés par des analyses en microcosmes soumis au laboratoire à des stress similaires viseront à corréler ces bio-indicateurs aux indicateurs physico-chimiques définis grâce à une palette d’outils d’analyse de la matrice tellurique. Ces travaux s’accompagneront d’une étude relevant du domaine SHS sur la perception par les communautés rurales de l’évolution des sols et le développement de cadres organisationnels d’une collaboration multipartite en rapport avec la vulnérabilité des sols.