– METHISTONARA
Les histones, composants protéiques majeurs de la chromatine, sont soumises à divers types de modification chimique dont un particulier est la méthylation. La méthylation d'histones joue des rôles complexes dans l'activation ou la répression de transcription, en fonction du résidu d'acide aminé méthylé et du degré (mono, di ou tri) de méthylation, elle affecte non seulement d'autres types de modification d'histones mais également la méthylation d'ADN, et suscite ainsi un intérêt croissant de la recherche actuelle en Europe et aux USA. De même que la methylation d'ADN, la méthylation d'histones semble constituer un élément clé pour la compréhension des mécanismes de transmissions des informations épigénétiques chez les eucaryotes. Il a été longtemps supposé que des facteurs environnementaux puissent affecter l'épigénome, avec comme avantages une régulation simultanée d'une batterie de gènes et/ou la transmission aux cellules filles après division mitotique voire, chez les végétaux, à la descendance. Nos travaux récents ont identifié le gène SET DOMAIN GROUP8 (SDG8) comme étant responsable d'une méthylation au niveau de H3K36 (lysine 36 sur l'histone H3), laquelle s'avère nécessaire à l'expression de FLOWERING LOCUS C (FLC), un répresseur de floraison chez Arabidopsis. FLC joue un rôle clé dans la réponse à la vernalisation, le processus épigénétique le mieux étudié à cause de son importance agronomique et de son aspect de signalisation de réponse au froid. Nos résultats non publiés montrent que le promoteur de SDG8 est induit par blessures et probablement aussi par pathogènes, et que de nombreux gènes potentiellement impliqués dans la réponse aux stress sont réprimés chez le mutant nul sdg8. L'ensemble de ces résultats font de SDG8 un gène modèle très original pour appréhender le rôle de la méthylation d'histones dans l'adaptation environnementale des plantes. Notre projet de recherche porte sur : (1) des caractérisations approfondies de l'expression de SDG8 à la réponse à divers facteurs biotiques et abiotiques ; (2) des études comparatives entre le mutant sdg8 et le sauvage pour leur réponse aux stress ; 3) des analyses de profils de méthylation d'histones en réponse aux stress chez le sauvage et le mutant sdg8, à la fois au niveau des régions gène-spécifiques et à l'échelle du chromosome entier. Une comparaison des données de type 'ChIP-CHIP' et de transcriptome nous permettra de vérifier la corrélation entre la méthylation d'histones et la transcription sous différentes conditions environnementales.
Coordination du projet
Wen Hui SHEN (Organisme de recherche)
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Partenaire
Aide de l'ANR 200 000 euros
Début et durée du projet scientifique :
- 36 Mois