Projets financés
Rôle de la nano-organisation spatio-temporelle dans la régulation de la spécificité de la voie de signalisation JAK/STAT – NANOSTAT
Nous dévoilerons les déterminants de l'assemblage et du trafic endosomal des IFN-Rs de type I (IFNAR) et II( IFNGR). Nous proposons que les IFNR de type I (IFN alpha/beta) et de type II (IFN gamma) représentent l'un des meilleurs paradigmes pour étudier la complexité de ces mécanismes puisque IFNAR
Structure des chromosomes bactériens revélée a haute résolution – HiResBaCS
The main goal of HiResBaCS is to unravel the interplay between the multiple levels of organization of bacterial chromosomes and the impact of this organization on the regulation of DNA-management functions such as gene expression, DNA replication, and segregation. To achieve this general goal, the p
Structure, activité et analyse génomique de co-activateur SAGA – SAGA2
Notre objectif est de décrypter la structure et la fonction du co-activateur transcriptionnel SAGA dans la régulation de l'expression génique en combinant des approches de cryo-microscopie électronique, de profilage transcriptionnel à l’échelle du génome et d’analyses mutationnelles in vivo. La régu
Fidélité et structure du ribosome étudiée par analyse aux rayons X. – RFS
La synthèse des protéines est un processus cellulaire hautement régulé qui affecte la croissance, la reproduction et la survie en réponse aux indices intrinsèques et extrinsèques. Les mécanismes moléculaires responsables des différences de longévité entre les organismes vivants sont en grande partie
Bases moléculaires de l'entrée des rhabdovirus dans la cellule hôte – MoBaRhE
L’objectif de ce projet est de caractériser les bases moléculaires de l’entrée des rhabdovirus dans la cellule hôte. Il comprend deux axes qui visent à : 1) Etudier l’interaction entre la glycoprotéine du virus de la stomatite vésiculaire (VSV) et celle du virus de la rage (RAV) et leurs récepteur
Bases moléculaires de la virulence de Porphyromonas gingivalis, un pathogène bucco-dentaire – TOOTHPASTE
Les parodontites et gingivites sont considérées comme un problème de santé majeur au niveau mondial. Près de 36% de la population mondiale (20% dans les pays industrialisés) souffre de ces maladies dentaires et de perte de dents. Bien que d’autres facteurs entrent en jeu, les parodontites et gingivi
Pneumonie hémorragique à Pseudomonas aeruginosa : étude de nouvelles stratégies de virulence – HemoPseudo
Dans ce projet, nous avons démarré des études intégrées sur les isolats clinique de Pa utilisant Exolysine pour l'infection. Ces études combinent la microbiologie, biochimie, biologie cellulaire et les screens génétiques à haut-débit. En particulier le projet Hemo-Pseudo a pour but à : - comprendre
Analyse de la synapse GABAergique par des approches structurales et génétiques dans l'organisme modèle C. elegans – GABAREL
Le GABA est le principal neurotransmetteur inhibiteur dans le système nerveux. Des modifications de la neurotransmission GABAergique sont impliquées dans des pathologies neurologiques et psychiatriques majeures telles que l'épilepsie, les syndromes autistiques ou la schizophrénie. Malgré une caracté
Une nouvelle approche pour inhiber la signalisation ErbB2 et élaborer de nouveaux candidats-médicaments : Cibler les domaines EGF de son partenaire membranaire la mucine MUC4 – DRUG_MUC4
Le but général du projet DRUG_MUC4 est d’étudier la relation structure-fonction du complexe MUC4-ErbB2 et de proposer de nouvelles petites molécules thérapeutiques inhibitrices ciblant les domaines EGF1/2 de la mucine MUC4. The main aim of that project is to understand for the first time how the EG
Séquence et structure des signaux d'empaquetage du génome du virus influenza A – PSiFlu
Les virus influenza A (VIA) sont responsables d’épidémies grippales saisonnières et de pandémies dévastatrices occasionnelles chez l’homme et l’animal. En plus de la grippe saisonnière, responsable de 250 000 à 500 000 décès par an, de nouveaux VIA avec un potentiel pandémique élevé émergent réguliè
Bases structurales des modifications de la synthèse lipidique induites par la Viperin au cours de l'infection virale – VipVir
La Viperin (virus inhibitory protein, endoplasmic reticulum-associated, interferon-inducible) est une protéine issue de la stimulation des gènes par l’interféron et qui possède une activité antivirale contre de nombreux virus pathogènes enveloppés comme le cytomégalovirus, le virus influenza A, de l
Mecanisme de résolution des intermédiaires de recombinaison méiotique de la levure à la souris – Resolve
Une question clé est d’identifier les protéines directement impliquées dans la résolution des dHJ, une réaction qui nécessite deux coupures coordonnées chacune de deux brins d’ADN, et de comprendre pourquoi ces deux coupures se font toujours de manière asymmétrique, qui fait que seuls des crossing o
Restructuration de la cellule bactérienne par l'infection virale – BacVirRemodel
Nous avons décrit les effets cytologiques de l’infection de SPP1 sur la bactérie Bacillus subtilis et une partie majeur du réseau d’interactions des effecteurs nécessaires pour la multiplication de SPP1 dans la cellule hôte. Le projet actuel se base sur ces travaux et vise à analyser en temps réel l
La maturation de l'ARN ribosomique et son lien avec le contrôle de qualité de l'assemblage du ribosome – ARNr-QC
Les ribosomes, ces grands complexes ribonucléo-protéiques impliqués dans la synthèse protéique, sont essentiels à la vie. Dans les cellules qui se divisent rapidement, leur biosynthèse représente la majeure partie de l’activité transcriptionnelle et de la consommation en énergie de la cellule. Les e
Développement et application de la spectroscopie de forces à haute vitesse pour la biologie – BioHSFS
Les nanotechnologies ont ouvert le champ d’étude de la mécanique des biomolécules individuelles. La microscopie à force atomique (AFM) combine mesures de force et images avec une sensibilité du piconewton et une résolution nanométrique. Néanmoins, la résolution temporelle des mesures de force demeur
Études stucturales de la protéine Tax du HTLV – SinTax
La protéine virale Tax joue un rôle clé dans la pathogénicité d'HTLV-1. Résoudre sa structure atomique ouvrirait des pistes pour le développement de nouvelles thérapies anti-HTLV-1. Cependant, du fait des ses multiples fonctions, il est probable que Tax possède des conformations différentes selon le
Le pont tournant: structure et dynamique de site de contact entre membranes formés par l’échangeur OSBP de stérol/PI(4)P. – SwingBridge
The overall goal of the project is to obtain the first 3D functional structural and dynamical model of OSBP in MCS. We want to highlight two particularly innovative aspects of this project. The first is the use of cryo-EM to determine the MCSs structure. Cryo-EM will provide 3D models of both protei
Dynamique fonctionelle d'une nanomachine impliquée dans la qualité du protéome: une étude croisée SAXS/SANS/RMN sur l'unfoldase PAN – PROTstretch
La destruction spécifique des protéines dans des cellules biologiques est un des mécanismes majeurs, avec le contrôle de la transcription et traduction, qui régulent et assurent un protéome (c.à.d. l'ensemble des protéines) en bonne santé. Une étappe clé dans ce processus est la reconnaissance spéci
Nouveaux canaux et transporteurs régulés par la lumière pour l'optogénétique – NEWOPTOGENETICSTOOLS
L’optogénétique est une avancée technologique majeure qui révolutionne notre capacité à étudier les processus neuronaux, promettant de nouvelles approches pour le traitement de différentes maladies et handicaps. Les outils de base de l’optogénétique sont les opsines, protéines membranaires contrôlée
Les interactions biomoleculaires révélées par la fluorescence PICOseconde dans des PICOlitres – PICO2
Les interactions biomoléculaires se caractérisent par une grande hétérogénéité structurale (coexistence de plusieurs conformères) et dynamique structurale (de la picoseconde à plusieurs minutes). La compréhension détaillée des mécanismes moléculaires sous-jacents est d’un intérêt essentiel pour la c
Etudes par résonance magnétique nucléaire du rôle du désordre dans les voies de signalisation cellulaire MAPK – NMRSignal
Au cours de la dernière décennie, la biologie structurale classique a connu une transition vers un paradigme plus dynamique avec la découverte qu’une protéine peut être fonctionnelle en l’absence d’une structure tridimensionnelle stable. On estime qu'une fraction importante (jusqu'à 40%) des protéin
Caractérisation biochimique et structural des complexes protéiques MnmE/MnmG et GTPBP3/MTO1 impliqués dans la modification redox d’ARNts chez les bactéries et chez l’Homme. – MiGRATe
Nous avons choisi de focaliser notre projet sur les complexes enzymatiques MnmEG et GTPBP3/MTO1 complexes pour plusieurs raisons: Le mécanisme de réaction catalysé par MnmEG est encore un sujet de discussion. En ce qui concerne GTPBP3 / MTO1, rien n'a été fait au niveau biochimique et structurale.
Principes moleculaires de reconnaissance entre la proteine Polycomb SCML2A et longs ARN non-codants – lincRNPs
Les complexes PRC1 et PRC2 (de l’anglais: «Polycomb repressive complexes») sont des complexes protéiques conservés au cours de l’évolution, qui régulent l’embryogenèse et la différentiation des cellules souches. Ces complexes modifient chimiquement la chromatine par ubiquitination ou méthylation des
Ancrage des corps basaux pendant la ciliogenèse : analyse structure-fonction – ANCHOR
Des approches multi-disciplinaires combinant des techniques de biochimie et de biologie cellulaire avec des techniques ultrastructurales à haute résolution seront utilisées (cryo-tomographie électronique et STEM). Nous allons : 1) identifier de nouvelles protéines impliquées dans le processus d’a
Caractérisation et importance physiologique de la biosynthèse d'ubiquinone sous différentes tensions d'oxygène – (An)aeroUbi
Comme de nombreux microorganismes, E. coli est une bactérie anaérobie facultative qui peut croitre en anaérobiose (absence de dioxygène) ou en aérobie afin de s’adapter aux concentrations variables en dioxygène rencontrées dans divers environnements. L’ubiquinone (UQ) est connue pour participer au m
Vers une vision integrée des mecanismes du terminateur transcriptionnel Rho – IntegRhoMe
L'émergence de souches bactériennes hyper-virulentes et/ou multi-résistantes aux antibiotiques souligne l’importance de mieux comprendre les mécanismes qui permettent aux bactéries d’évoluer en incorporant des gènes d’origine extérieure. L’amélioration de ces connaissances est ainsi une étape incont
Caracterisation Structurale des Couplages entre Chromatine et Homeostasie Protéique par Combinaison d'Analyses de Coevolution et de Perturbation des Interfaces de Complexes a Haut-Debit – CHIPSeT
Cette stratégie s’appuie sur le criblage d’interfaces de complexes à haut débit couplé au développement de méthodes bioinformatiques pour modéliser la structure des assemblages protéiques. Le projet se focalisera sur les interactions croisées entre deux voies majeures participant à l’homéostasie cel
Assemblée de CMH de classe II : Etudes structurales des interactions protéines-protéines et protéines-lipides au sein de bicouches membranaires – InMembrane
La fonction des protéines membranaires dépend des interactions à la fois à l’intérieur et à l’extérieur de la bicouche dans laquelle elles sont ancrées. Alors que les modules d’interactions protéine-protéine dans la membrane sont décrits, les connaissances sur les interactions spécifiques protéine-l
Microscopie optique non-linéaire et sans marquage du métabolisme et de la distribution de myéline sur des tissus intacts – NLOMMIT
La sclérose en plaques (SP) provoque la destruction de la myéline intrinsèquement normale (démyélinisation) et perturbe le métabolisme cellulaire, ce qui conduit à la neurodégénérescence. La myéline est une structure lipidique omniprésente au sein du système nerveux, et elle est essentielle à la co
