Projets financés
Régulation post-transcriptionnelle de la réponse au stress thermique chez la plante – HEAT-ADAPT
La survie de tous les organismes vivants dépend de leur capacité à adapter leur programme d'expression génique aux variations de leur environnement. Cela est particulièrement vrai pour les plantes terrestres qui n’ont pas comme les animaux la capacité de se soustraire aux conditions difficiles. En o
Mécanismes moléculaires et impact de la voie de dégradation des ARNm nonsense (NMD) sur le transcriptome eucaryote. – CLEANMD
Analyse exhaustive des facteurs associés au NMD chez la levure. Analyses fonctionnelles du NMD. Des purifications par affinité ont tout d’abord été réalisées avec des facteurs connus du NMD chez la levure (Upf1, Upf2, Upf3) et analysées par spectrométrie de masse quantitative (LFQ). Des purificat
ANALYSE DE LA DYNAMIQUE DE MARQUES EPIGENETIQUES PAR CHIP-SEQ SUR CELLULES INDIVIDUELLES AU COURS DE LA PHASE S ET DE L’EMBRYOGENESE CHEZ DES MAMMIFERES – CELLECTCHIP
Dans les cellules eucaryotes, la mise en place, le changement et/ou la transmission d’informations ou marques épigénétiques portées par la chromatine représente un enjeu majeur pour les fonctions cellulaires et le destin cellulaire. Appréhender la dynamique de ces marques est donc critique pour comp
Mécanismes moléculaires d'une nouvelle fonction du Médiateur liant la transcription et la réparation de l'ADN chez les eucaryotes – MEDinREPAIR
Le Médiateur de la régulation transcriptionnelle est un grand complexe multiprotéique (1,5 MDa), conservé dans tous les eucaryotes. Il joue un rôle crucial dans l’activation de la transcription par l’ARN polymérase II (Pol II). Chez l’homme, les mutations du Médiateur provoquent des pathologies grav
Anomalies de la duplication du génome provoquées par la carence en recombinaison homologue. – StressHoR
La progression des fourches de réplication est fréquemment affectée par des stress endogènes qui mettent en péril le succès de la réplication des chromosomes et la stabilité des génomes. Les stress réplicatif endogènes induisant une instabilité génomique sont donc une problématique biologique univer
Role des polymérases spécialisées dans la réplication normale: nécessaire pour la duplication des régions d'hétérochromatine au cours de la différenciation cellulaire , conséquence sur la mutagenèse spontanée – SPUR
La duplication du génome durant la phase-S se produit de manière spatialement et temporellement organisée reflétant ainsi une certaine organisation du génome. En effet, l'euchromatine est d'abord répliquée, suivie par l'hétérochromatine facultative durant le milieu de la phase-S, pour finir par l'hé
Génèse et maintenance des chromosomes secondaire bactériens – MAGISBAC
Les génomes bactériens sont composés de chromosomes et de plasmides. Les plasmides sont des éléments génétiques mobiles acquis par transfert horizontal entre souches ou espèces bactériennes. Leur domestication est d'une importance cruciale pour l'acquisition par leurs hôtes de nouvelles fonctions, s
Domestication de transposases et épigénétique: Impact sur la dynamique des génomes – PIGGYPACK
Les transposases se fixent généralement à des motifs de séquence spécifiques aux extrémités de leur transposon d'origine. Ce projet est centré sur le rôle de transposases domestiquées dans l'élimination programmée d'ADN germinal qui se produit pendant la différenciation du noyau somatique chez le c
Propriétés uniques des petits ARNs régulateurs bactériens dans les réseaux transcriptionnels et le contrôle traductionnel – UnifyRNA
Les petits ARN régulateurs (ou sRNAs pour «small RNAs«) sont maintenant reconnus comme des régulateurs-clé chez les bactéries où ils sont impliqués dans de nombreux processus biologiques. De nombreuses études réalisées par plusieurs laboratoires ont mis à jour des aspects fondamentaux de la biologie
Variation évolutive des mécanismes moléculaires contrôlant l'hérédité épigénétique chez C. elegans – EvolEpiElegans
Nous proposons de répondre à cet objectif en caractérisant la variation génétique naturelle de systèmes d'héritabilité épigénétique chez le nématode Caenorhabditis elegans. Nous avons établi des paradigmes expérimentaux de transmission multigénérationnelle de défauts de fertilité induits par des str
Fonction de la chromatine dans la réparation des DSBs. – DIvA
Premièrement, de nombreuses évidences (nos travaux, (Aymard et al, 2014), ainsi que d'autres études suggèrent que l'environnement chromatinien dans lequel survient une DSB pourrait influencer de façon majeure la voie de réparation utilisée. Puisque les différentes voies de réparation peuvent laisser
Une investigation génétique sur la mort subite cardiaque – GenSuD
Nous explorerons des formes familiales de SOJ et évaluerons l'implication relative de tous les gènes de susceptibilité à ces syndromes dans des cas de MSC issus de la population générale. Enfin, nous poursuivrons l'étude d’association récemment publiée sur le syndrome de Brugada, afin de stratifier
Prévention et résolution des chromosomes dicentriques – DICENs
Plus précisément, nous explorerons les déterminants de la formation des dicentriques dans des cellules cyclantes et quiescentes, ainsi que l’impact de l'organisation nucléaire et de stress endogènes ou exogènes (dont les cassures double-brin). Nous examinerons également comment des mécanismes spécif
Mécanisme et régulation de la dissociation des cohésines de l'ADN – FineTuneCohesion
The general objective is to understand how Protein Phosphatase 4 regulates sister-chromatid cohesion, the identification of the relevant substrates of PP4 and understanding the underlying mechanisms. We identified two key serine residues within Rad21 which when phosphorylated shelter cohesin from Wp
Le choix des origines de réplication dans le contrôle de la stabilité génomique et l'identité cellulaire – ORICHOICE
A chaque division cellulaire, la réplication de l'ADN permet la transmission fidèle aux cellules filles de l'information génomique contenue dans nos chromosomes. C’est un processus de base du développement embryonnaire, qui permet également le renouvellement de millions de cellules à chaque seconde
Etude systématique de l'expression des gènes à l'échelle des molécules uniques d'ARN – HI-FISH
L'étude de l'expression des gènes est un thème fondamental de la biologie. De nombreuses études ont caractérisé le profil d'expression des gènes humains, mais ces études ont le plus souvent mesuré des niveaux d'expression sur des populations de cellules. Ainsi, deux paramètres importants n'ont pu êt
Aspects évolutifs et fonctionnels du génome non-codant : le paradigme de l'inactivation du chromosome X – NoncodiX
Nous proposons donc l’étude fonctionnelle de plusieurs lncRNAs candidats, dont certains sont conservés entre espèces et d’autre non. Ces études seront essentiellement menées dans le contexte de cellules souches embryonnaires humaines et murines, qui représentent un stade critique ou l’inactivation d
Etude de la deregulation des microRNA dans les mitochondries des patients atteints de FXTAS. – MITO-FXTAS
Fragile X-associated tremor/ ataxia syndrome (FXTAS) is an inherited neurodegenerative disease caused by 55 to 200 expanded CGG repeats in the FMR1 gene. Patients are characterized by progressive intention tremor, gait ataxia and cognitive decline. Importantly, FXTAS shares some common features with
La réparation de l’ADN dans le paysage chromatinien et pendant la transcription – DyReCT
L'intégrité du génome est constamment mise en danger par une variété d'agents toxiques qui induisent des lésions sur la molécule d'ADN. La cellule a mis en place des systèmes de réparation de l’ADN qui vont rétablir la séquence d’ADN correcte. Parmi les systèmes de réparation que la cellule utilise
Rôles génomiques et extragénomiques de RTEL1 – GENEXGERTEL
RTEL1 est une hélicase essentielle impliquée dans la réplication et maintenance télomérique et génomique chez la souris. Chez l'humain, des mutations dans le gène RTEL1 ont été associées au syndrome de Hoyeraal-Hreidarsson (HSS) mais son rôle demeure obscur. Nous avons développé des outils spécifiqu
Methylation du génome germinal guide par de petits ARNs – GuidedMethylation
Les petits ARN servent de guides pour des machineries de “silencing” qui agissent au niveau post-transcriptionnel ou transcriptionnel, dans la plupart des organismes y compris les virus, les plantes et les animaux. Les lignées germinales des animaux expriment une classe spéciale de petits ARN appelé