Projets financés
Complexité du métabolisme phénolique chez les végétaux : exploration de nouvelles voies de biosynthèse des précurseurs de la paroi cellulaire – PHENOWALL
Les cytochromes P450 catalysent les étapes limitantes et irréversibles du métabolisme phénolique (étapes d’oxydation). Certains d’entre eux se sont dupliqués au cours de l’évolution précoce des plantes à graines et des monocotylédones (céréales, graminées). Ces duplications ont été conservées chez l
Remaniements conformationnels des ribozymes de groupe II – GRP2CONF
Les introns dits ‘de groupe II’ des génomes bactériens et d’organelles constituent des rétrotransposons, dont l’excision sous forme de structure branchée (‘lariat’) à partir d’un ARN précurseur et l’insertion dans des cibles ADN sont catalysées l’une et l’autre par un grand ribozyme, inclus dans l’i
Etude des synthases de cyclodipeptides (CDPS), une nouvelle famille d'enzymes utilisant des ARNt aminoacylés pour former des liaisons peptidiques – CyDiPepS
Les CDPS détournent les ARNt aminoacylés, des molécules dévolues à la synthèse protéique ribosomale, pour les utiliser comme substrats et ainsi catalyser la formation des liaisons peptidiques de différents cyclodipeptides. Ce sont des enzymes originales qui ne sont apparentées ni aux aminoacyl-ARNt
Développement de sondes d’imagerie magnétiques et optiques et leur validation in vivo pour la détection d’activité enzymatique liée à l’infection – ENZYMAGE
Alors que la mise en évidence d’un disfonctionnement cellulaire à l’échelle moléculaire est aujourd’hui techniquement possible in vitro, sa visualisation en temps réel in vivo reste un défi majeur de l’imagerie. C’est dans ce cadre que nous proposons de concevoir des sondes magnétiques et optiques p
Rôle de la protéine TRF2 et de ses partenaires dans la formation et la stabilité de la t-loop des télomères humains – TELOLOOP
L’extrémité des chromosomes humains porte une structure appelée Télomère qui joue un rôle crucial dans le cancer et dans le vieillissement. En effet, cette structure est un des garants de la stabilité du génome. Or, les télomères raccourcissent à chaque division de la cellule jusqu’à une taille crit
Contrôle spatial et temporel de la formation de synapses via les molécules d’adhérence neurexine/neuroligine – Synapse-2Dt
Notre apport principal a été de développer de nouveaux systèmes biomimétiques fondés sur ces molécules d’adhérence purifiées, pour induire une différentiation synaptique contrôlée dans le temps, ou dans l’espace. L’utilisation d’outils de simulation numérique et de techniques de microscopie super-ré
Dynamique structurale et fonctionnelle des évènements co-traductionnels survenant au voisinage des ribosomes – RIBO-Dyn
Un certain nombre de facteurs RPBs (Ribosome-associated Protein Biogenesis factors) interagissent avec les nouvelles chaînes polypeptidiques au niveau du tunnel de sortie du ribosome pour prendre en charge le repliement 3D, effectuer des modifications cotraductionelles et/ou induire des translocatio
Observation de l'activation du récepteur des lymphocytes T (TCR) en temps réel: suivi des orientations dynamiques du domaine intracellulaire du complexe récepteur dans les cellules vivantes par imagerie en fluorescence polarisée résolue de temps – ReceptOrient
Nous étudierons le processus d'activation du TCR – initiation de cascades signalisation intracellulaire suite à l'engagement du récepteur par son ligand pMHC. Les études récentes dans les systèmes modèles suggèrent qu'une étape essentiel et le plus précoce dans l’activation du TCR est le changement
Métastases Osseuses Traitées par UltraSons et un bisphosphonate – MOTUS
Les métastases osseuses sont des complications fréquentes des cancers du sein. Elles sont responsables, de complications qui peuvent engager le pronostic vital ou aggraver rapidement la qualité de vie des patients. Ces métastases osseuses sont ostéolytiques, c’est-à-dire qu’elles provoquent une dest
Complexes de protéines membranaires dans la signalisation : rôle d'interactions entre domaines transmembranaires – interferenceTM
De plus en plus de données démontrent l'importance d'interactions entre récepteurs sur la surface cellulaire pour leur activation, qui est souvent dérégulée dans les cancers. Les domaines transmembraires qui permettent l'expression à la surface de ces récepteurs peuvent participer à ces interactions
Réduction des quinones et organisation en supercomplexe: les deux énigmes des complexes Rieske/cytb – BIsP
Purification des complexes et/ou supercomplexes de Geobacillus et des Heliobactéries devrait être suivi de leur caractérisation par spectroscopie UV/VIS et RPE et leur cristallisation. La cristallisation d'un spercomplexe n'a jamais encore été réussi est nécessite une mis au point d'une préparation
Intégrine alpha 5beta1 : Une cible pour favoriser la régénération osseuse – Integros
On dispose actuellement de très peu de moyens thérapeutiques pour favoriser l’ostéogénèse dans les grandes pathologies osseuses (réparation de fracture, régénération osseuse, ostéoporose) caractérisées par une diminution de cellules compétentes. Les cellules mésenchymateuses sont capables de se diff
Etudes structurales pour comprendre le mécanisme de production de force des moteurs myosines et identifier les interactions critiques qui régulent leur localisation cellulaire. – How myosin produces force
La cellule comprend de nombreux moteurs moléculaires essentiels non seulement à sa division et à sa migration mais également nécessaires pour le transport polarisé, le maintien des ultrastructures de la cellule ou pour l’ancrage de vésicules ou d’organelles en son sein. Le projet proposé dans cet
Fonction, mécanismes d'action, et spécificité des hélicases à boîte DEAD – HelicaRN
Ce projet de recherche fondamentale propose l’étude d’une famille d’enzyme essentiels à la biologie de l’ARN chez tous les organismes, les hélicases à boîte DEAD. Ces enzymes, dont l’expression inappropriée chez l’homme provoque parfois le cancer, ont la capacité de modifier ou de stabiliser la stru
Orthèses moléculaires favorisant la cristallisation de protéines membranaires. Application à la détermination structurale de pompes d’efflux multi-drogues – X-Or
Les protéines membranaires ont des fonctions essentielles, très diversifiées, et constituent donc des cibles de tout premier ordre pour la recherche thérapeutique. Toutefois, les protéines membranaires restent problématiques pour des études structurales car elles sont insolubles dans l’eau. En dépit
Caracterisation structurale complete des formes ouverte et fermee d'un canal ionique de la famille des recepteurs cys-loop et mecanisme moleculaire de la transition – Nico_chimera
Les enjeux de ce projet sont de mieux comprendre au niveau moléculaire le fonctionnement de médicaments comme les anesthesiques ou les benzodiazepines, leurs effets et leur emploi par rapport aux acteurs majeurs de la transmission du signal de l'influx nerveux. En particulier nous nous interessons a
Recherche d’antagonistes interrompant l’angiogenèse par une interaction avec le domaine d2 du VEGFR-1 – SALSA
Ce projet vise à concevoir de nouveaux antagonistes du facteur de croissance endothélial vasculaire (VEGF) dirigés contre les récepteurs du VEGF (VEGF-R). Plus précisément nous allons cibler le récepteur 1 qui est impliquée dans l'angiogenèse tumorale c’est à-dire la formation de nouveaux vaisseaux
Radiothérapie par Photo-Activation d’Eléments LOurds – RAPHAELO
Ce projet a pour but de proposer une technique de radiothérapie innovante reposant sur la photo-activation d’éléments absorbants. Il comporte quatre objectifs principaux : . L’étude in vitro de divers agents photo-activables et l’étude physico-chimique des dommages induits par l’irradiation. .
Identification et caractérisation moléculaire des signaux de sécrétion des protéines de virulence sécrétées par de système de sécrétion de type 2 bactérien – SecPath
Les systèmes de sécrétion de type II (T2SS) permettent à de nombreuses bactéries pathogènes de sécréter des protéines de virulence. Malgré de nombreuses études antérieures, le motif de reconnaissance des exoprotéines par les T2SS est encore inconnu. L’objectif de ce projet est de caractériser les él
Substitut vert de fibronectine et fonctionalisation de matériaux – Green Fib
Des stratégies récentes en biomatériau ont cherché à fixer à la surface des implants des molécules reconnues par les cellules comme la fibronectine (FN). La FN utilisée dans le domaine des biomatériaux est généralement purifiée à partir du plasma humain (pFN). Nous avons démontré précédemment qu’i
Nouveaux outils de spectroscopie ultra-rapide et de simulation pour l'étude de la dynamique structurelle de complexes protéines chaperonnes/ADN – FEMTOSTACK
Le projet vise à établir la spectroscopie ultra-rapide comme outil d'étude pour l' hétérogénéité structurale complexes biomoléculaires. Ce concept est appliqué à l'étude de complexes en équilibre et hors-équilibre. La comparaison avec des méthodes de dynamique moléculaire avancées permettra de mettr
Nanotubes de carbone ultra-courts : des nano-marqueurs proche-infrarouges pour le suivi de biomolécules dans des tissus vivants du cerveau. – UshortNT
Ces dernières années, l'observation de molécules individuelles a révolutionné´ la microscopie optique. Ce domaine est promis à jouer un rôle décisif dans la compréhension de la biologie à l'échelle nanométrique. La microscopie de molécules individuelles souffre pourtant de limitations sérieuses qui
Régulation de l’activité des protéases Tolloïdes au cours du remodelage tissulaire: étude structurale des mécanismes impliqués, conception d’inhibiteurs innovants et de sondes de type "activity-based probes" – TOLLREG
Les métalloprotéases Tolloïdes jouent un rôle majeur au cours du développement embryonnaire et de la réparation tissulaire en synchronisant la synthèse de la matrice extracellulaire avec l’activation de certains facteurs de croissance. Le dépôt excessif de matrice extracellulaire, constitué majorita
Mécanisme de la terminaison transcriptionelle par le facteur Rho – TERMINATOR
Ce projet vise à élucider le mécanisme par lequel Rho agit pour empêcher l’expression d’un gène, en stoppant la transcription de l’ADN. Il s’agit d’un mécanisme très général de régulation génique chez les bactéries telles que E. Coli. Par ailleurs, Rho constitue la cible privilégiée pour des antibio
Régulation moléculaire de la biosynthèse des Galactolipides chloroplastiques – ReGal
Le projet RéGal vise à comprendre les mécanismes intimes qui régissent la production du lipide le plus abondant des membranes photosynthétiques, un processus de ce fait essentiel pour la production agricole. L'enjeu est de combiner des approches structurales, biomimétiques et physiologiques. Avancée
Microscopie STED accordable résolue en temps pour une imagerie dynamique des interactions à l'echelle subcellulaire. – STED-FLIM
L’objectif est de développer un système de microscopie STED à super-résolution accordable en longueur d’onde afin de pourvoir exciter une large gamme de fluorophores d’intérêt biologique, voire plusieurs fluorophores simultanément. En outre, la mesure de la fluorescence pourra être effectuée de mani
Reconnaissance d’homologie et échange de brin d’ADN catalysés par RAD51: ordre et dynamique des monomères de RAD51 au sein de filaments et pendant l’interaction du filament avec une molécule d’ADN duplex. – RADORDER
La recombinaison homologue est un processus universel de la vie, essentiel au maintien de l’intégrité génomique, à la survie cellulaire et à la protection contre la tumorigenèse. La duplication fidèle du génome, la ségrégation des chromosomes et la réparation des cassures double brin de l’ADN dépend
Transistors à base de polymères pour enregistrements multimodaux in vivo – MUSIC
• Développement des sondes capables de multi-détection simultanée de potentiels de champs locaux et les courants ioniques des neurones in vivo. • Développement des sondes capables de multi-détection simultanée de potentiels de champs locaux et de la concentration du glucose in vivo. • Dévelo
Imagerie parallélisée de sécrétions cellulaires – Mult-I-Cell-S
Les cascades immunitaires sont des mécanismes particulièrement complexes en raison du nombre important des différents types cellulaires impliqués, et du large spectre de cytokines (qui sont des messagers entre les cellules) libérées par ces cellules. Bien que cette voie de défense des organismes so
Mécanismes moléculaires de transport dans les mitochondries – MIT-2M
La première structure d’AAC résolue par un des partenaires du projet en 2003, reste toujours la seule structure connue à haute résolution. Cette structure a apporté le premier éclairage sur les transporteurs mitochondriaux. Elle montre le repliement général et le mécanisme d’inhibition des atractylo
Développement d’un aptacapteur avec amplification électro-catalytique pour la détection sensible et énantiosélective de drogues amphétaminiques – ECSTASE
A l’heure actuelle, les méthodes de dépistage des amphétamines et de ses métabolites associés sont réalisées sur des échantillons urinaires. Elles reposent majoritairement sur des tests immunochimiques qualitatifs rapides, mettant en jeux une mesure généralement colorimétrique (voire même tout simpl
Physique de la morphogenèse des plantes: propriétés dynamiques et mécaniques de la paroi des cellules du méristème – MechaStem
Au cours des trente dernières années, de nombreux progrès ont été réalisés dans le domaine de la recherche sur le développement des organismes et nous connaissons aujourd’hui les grandes familles de gènes responsables de la croissance et de la différenciation des cellules et des tissus. Toutefois, c
Molecular and cellular mechanisms of mechanotransduction and mechano-sensing at cell-cell junctions – MECANOCAD
La façon dont les cellules sont capables de percevoir et d’intégrer les propriétés de leur environnement et de répondre pour maintenir l’homéostasie à l’échelle de la cellule, du tissu ou de l’organe reste une des question centrale de la biologie moderne. La réponse cellulaire aux signaux mécaniques
Capsules à cœur aqueux : un outil polyvalent pour la culture cellulaire parallélisée et confinée en 3D – CAPCELL
Un des défis actuels importants de la biologie est d’amener les études faites actuellement en boîte de Pétri sur des monocouches de cellules à un niveau 3D, physiologiquement plus pertinent. L’objectif global de ce projet est de développer une nouvelle technologie d’encapsulation de cellules et d’en
Caractérisation moléculaire de l’assemblage et du fonctionnement enzymatique d’un complexe membranaire: la NADPH-oxydase – PROTOTYPE NOX
Les espèces réactives de l’oxygène (ROS) présentent à la fois des propriétés bénéfiques et délétères (cytotoxique, mutagène ou stress oxydatif). Leurs productions dans l’organisme, par conséquent, doivent être sévèrement contrôlées. Les enzymes de la famille des NADPH oxydase (NOX) sont les générat
Formulation nanoparticulaire de nitrosothiols en vue d'améliorer la biodisponibilité de l'oxyde nitrique; expertise toxicologique et pharmacologique – NanoSNO
La découverte de l’oxyde nitrique (NO) comme messager physiologique a ouvert un large champ d'investigation en thérapeutique, en particulier dans le traitement des maladies cardiovasculaires. Les composés donneurs de NO actuellement disponibles ont des indications restreintes. En effet, ils libèrent