Projets financés

Notre projet MMRDNABREAK vise à élucider le fonctionnement moléculaire d’une nouvelle voie de réparation des mésappariements (MMR). Ce mécanisme original dépend de l'endonucléase NucS présente chez de nombreuses archées et actinobactéries. L'inactivation de cette voie entraîne un phénotype hypermuta

L'exoribonucléase 3'-5' conservée EXOSC10 (Rrp6 dans la levure) est essentielle pour l'embryogenèse, le développement du cerveau antérieur et des globules rouges, la gamétogenèse et la division des cellules cancéreuses. Parmi les substrats les mieux étudiés de la protéine figurent les ARN ribosomiqu

La découverte fortuite des «virus géants», visibles au microscope optique, a ouvert un pan entier inconnu de la viropshère et remis en cause le concept classique de virus. Ces dernières années différentes familles ont été isolées à partir d’échantillons environnementaux qui, combinées aux données de

La signalisation par ADP-ribosylation contrôlée par PARP1 est un événement clé des premières étapes de la réponse cellulaire aux dommages dans l'ADN. Alors que des travaux récents ont permis d'élucider le rôle de l'auto-ADP-ribosylation de PARP1, les fonctions de l'ADP-ribosylation des histones rest

La protéine BRCA2 (BREAST CANCER TYPE 2 SUSCEPTIBILITY) est un régulateur central de la recombinaison homologue (RH) conservé au cours de l'évolution chez la plupart des eucaryotes. Pendant la HR, BRCA2 délivre les recombinases - RAD51 (RADiation sensitive 51) et DMC1 (Disrupted Meiotic cDNA 1) - au

Les ARN non-codants (ncRNAs) agissent sur des procédés multiples comme la repression ARN-dépendante, l’hétérochromatine ou la quiescence. En particulier, les ncRNAs influencent l’organisation 3D de la chromatine et l’assemblage des domains topologiques (TADs) ou encore des ‘condensats’ de chromatine

L’un des grands principes de l’architecture fonctionnelle des génomes eucaryotes consiste en leur repliement en boucles de chromatine par les ADN-translocases de la famille SMC. Des études in vitro montrent que les complexes SMC fixent l’ADN nu, et forment des boucles de taille croissante au travers

Une cellule humaine, outre l'ADN nucléaire, contient des milliers de copies d'ADN mitochondrial (ADNmt), une molécule circulaire à double brin de 16569 pb. Il a été proposé que l'ADNmt soit une cible critique des espèces réactives de l'oxygène, sous-produits générés dans l'organelle lors de la respi

Les télomères protègent les extrémités natives des chromosomes en les empêchant d'être reconnues et traitées comme des extrémités issues de cassures chromosomiques. Cette fonction essentielle des télomères est une pierre angulaire de la stabilité des chromosomes. L'incapacité à protéger les télomère

La maladie de Huntington (HD) est une maladie neurodégénérative rare, affectant de façon primaire le striatum. Les mécanismes précoces impliqués dans le dysfonctionnement des neurones HD sont mal compris. Des dérégulations précoces du métabolisme énergétique et de l’acétylation des histones, en part

L'altération du métabolisme de l'ARN est impliquée dans plusieurs maladies, notamment la dystrophie myotonique de type 1 (DM1). La DM1 est la maladie neuromusculaire héréditaire la plus fréquente de l'adulte, mais elle affecte des patients de tous les âges, des tissus et des types cellulaires variés

Les régulations post-transcriptionnelles de l'expression des gènes représentent une nouvelle terra incognita à explorer en biologie. Les processus de répression post-transcriptionnelle modulent la stabilité et la traduction de l'ARNm, contribuant au contrôle rapide et flexible de la synthèse protéiq

La conjugaison bactérienne est un mécanisme de transfert horizontal de gènes d’une bactérie donneuse vers une bactérie receveuse. La conjugaison a d'importantes implications en sciences de la vie, notamment l'évolution des génomes bactériens, les applications en bio-ingénierie et la dissémination de

Transcription et réplication se déroulent sur la même matrice ADN et la transcription représente une source endogène d'obstacles pour la machinerie de réplication. Cependant les mécanismes par lesquels le processus de transcription perturbent la réplication de l'ADN restent peu compris et plusieurs

La structure tridimensionnelle de la chromatine joue un rôle essentiel dans le contrôle de l’expression génique. On sait désormais que cette structure diffère largement entre lignées cellulaires et se trouve modifiée lors de l’activation cellulaire. Cependant, on ignore encore la façon dont la diffé

Alors que dans la majorité des espèces des programmes sophistiqués de protection et de maintenance de la chromatine existent, certaines espèces systématiquement excisent et éliminent des portions entières de leur génome dans leurs cellules somatiques. Ce phénomène d’élimination programmée de l'ADN (

Le chloroplaste est l'usine énergétique de la cellule végétale. Suite à l'évolution du génome de son ancêtre bactérien, la grande majorité des ~3000 protéines du plaste est désormais codée par le noyau et synthétisée par les cyto-ribosomes avant leur adressage au plaste. Des études récentes ont mis

L’information génétique est compactée en fibre de chromatine dont l’unité de base se compose de protéines histones. Les cellules reproductrices ont la particularité d’utiliser des variants d’histones uniques à chaque espèce et dont les fonctions restent encore mal comprises. Nos travaux ont montré q

Au cours des dernières années, différentes analyses systématiques ont montré qu'un nombre restreint de gènes subissent des changements significatifs d’expression lors du vieillissement. Plus récemment, des analyses multi-omiques ont révélé que la plupart des changements observés s'expliquent par une

L'élucidation de l'origine génétique de la diversité phénotypique au sein des populations naturelles reste un défi majeur en biologie. En effet, même une mutation dont l'impact fonctionnel est clairement défini peut conduire à une variété de phénotypes inattendus chez différents individus, à cause d

Les éléments régulateurs distaux, comme les enhancers, sont des acteurs essentiels du développement et de la maladie de par leur rôle dans le contrôle spatio-temporelle de l'expression des gènes. L'activation type-cellulaire-spécifique de ces régions est orchestrée par un groupe de facteurs de trans

NuA4 est un complexe lysine-acétyltransférase conservé au cours de l'évolution qui joue un rôle important dans l'expression des gènes, en créant un environnement de chromatine favorable à la transcription. L'équipe du coordinateur a découvert que dans la levure en herbe, NuA4 favorise également l'ex

La science des protéines est passée d'une focalisation sur des molécules individuelles et monofonctionelle à une perspective intégrée dans laquelle ces molécules émergent comme des acteurs dynamiques aux fonctions multiples. XPD, une ATP-dépendante ADN hélicase, peut se retrouver dans un large compl

Les paramètres épigénomiques tels que les modifications de la chromatine et leur propagation ont été activement étudiés. Cependant, comment relier la signalisation en amont imposée par des conditions cellulaires, physiologiques et métaboliques, avec le ciblage des enzymes impliquées dans le marquage

Le contrôle de l'expression des gènes repose sur des séquences cis-régulatrices. Cependant, dans de nombreux cas, ce contrôle nécessite également des interactions entre allèles homologues. Les mécanismes qui sous-tendent cette forme de régulation génique, appelée transvection, sont mal connus. La tr

L'hybridation entre lignées génétiquement distinctes est un phénomène omniprésent dans l'arbre du vivant. Les hybrides combinent des génomes qui ont évolué indépendamment pendant des millions d'années et se retrouvent soudainement réunis lors d’un cycle cellulaire. Ces génomes présentent des signes

L'épissage alternatif en permettant d'augmenter le répertoire des ARNm a un impact direct sur la fonction des protéines et donc sur le contrôle du destin cellulaire. De nombreuses données soulignent l’importance des modifications chromatiniennes qui favorisent ou défavorisent l'inclusion d'un exon a

La cohésine est un complexe annulaire conservé qui appartient à la famille des complexes de maintenance structurelle (SMC) du chromosome. En plus de conférer la cohésion des chromatides soeurs, la cohésine a la capacité de relier des loci intrachromosomiques distants dans la plupart des génomes. Ces

neuroSNORD est un projet multidisciplinaire qui concerne deux petits ARN C/D (SNORDs) spécifiques du cerveau - SNORD115 et SNORD116 - dont les gènes répétés sont soumis à l’empreinte parentale (seul l’allèle paternel est actif). Par des mécanismes antisens, les SNORDs dirigent des 2'-O-méthylations

Les récentes avancées technologiques ont accéléré la découverte de variants du nombre de copies, (CNVs ; délétion ou duplication de fragments d’ADN supérieurs à 1 kilobase), des lésions génomiques qui contribuent de manière importante aux traits neurodéveloppementaux, dont l'autisme. Cependant, le p

La plupart des ARN (ARNt, ARNm et ARNr) impliqués dans la synthèse des protéines sont ornés par de nombreuses modifications chimiques qui permettent d’optimiser la traduction des ARNm. Beaucoup des enzymes déposant ces modifications jouent un rôle critique dans le cycle cellulaire et des défauts de

Les télomères des mammifères sont composés d'ADN repete, sur lequel se lient spécifiquement un ensemble de facteurs dédiés, nommés Shelterines. Les Shelterines régulent la réplication des télomères, contrôlent leur taille et surtout, assurent leur protection. TRF2 est une Shelterin qui se lie spécif

L'empreinte génomique est le phénomène épigénétique chez les mammifères dans lequel l’expression mono-allélique des gènes est dictée par leur origine parentale. Les gènes soumis à l’empreinte jouent des rôles clés dans le développement, la croissance et le comportement. Leur perturbation épigénéti

Les cellules adaptent leur croissance et leur métabolisme à leur environnement en régulant l'expression de leurs gènes. La stabilité et l’intégrité de l'ARN, seul produit direct du génome, conditionnent cette expression pour assurer l'homéostasie cellulaire. Des altérations dans la dégradation et le

Les ARNt nucléaires sont transcrits par l'ARN polymérase III et maturés en 5' par des RNases P appelées PRORP2/3 chez les plantes. L'étude des réseaux d'interaction des protéines PRORP2/3 d'Arabidopsis a identifié de nouveaux substrats ARN et des partenaires protéiques. PRORP2/3 clive l'ARNm de MAF1

Les variants RNU4ATAC bialléliques sont responsables de 3 maladies récessives du développement très rares : les syndromes de Taybi-Linder (TALS, ou nanisme primordial microcéphalique osteodysplastique de type 1 (MOPD1)), Roifman (RFMN) et Lowry-Wood (LWS). Outre leurs traits cliniques communs (micro

L’émergence d’une nouvelle espèce est un processus clef pour la diversité biologique, qui se manifeste lorsqu’une population devient isolée sur le plan de la reproduction et diverge. Le syndrome DDK est un exemple emblématique d'isolement reproductif chez la souris, qui s’exprime par la létalité emb

Les nucléosomes, les unités élémentaires de la chromatine, sont constitués de ~146pb d'ADN entourées autour de 4 protéines histones (H3, H4, H2a, H2b) assamblées en tant qu'octamère. Etant donnés leur espacement tous les ~200pb et qu'ils occupent 90% du génome, les nucléosomes affectent toutes les

Les mutations de l'ADN ont des conséquences importantes, de l'évolution aux maladies. Les dysfonctionnements de la réparation de l'ADN et de la transcription, et les expositions aux mutagènes peuvent augmenter le taux de mutations. Il reste encore mal compris comment la relation entre ces processus

Le « nonsense mediated mRNA decay » (NMD) est la voie de surveillance majeure connue pour dégrader des ARNm aberrants contenant des codons stop prématurés. Nous avons identifié une population d'ARN déadénylés, fréquemment reconnus sous la forme de duplex sens-antisens et spécifiquement associés à Up

Les facteurs de transcription se lient aux régions régulatrices de l'ADN pour réguler l'expression des gènes. La chromatine et la méthylation de l'ADN modulent leur accès à l'ADN. L'incapacité à maintenir cette régulation de l'expression des gènes entraîne des défauts de développement et diverses ma

Les graines ont une importance biologique et économique capitale. Leurs caractéristiques agronomiques, telles que leur vigueur et leur valeur nutritionnelle, sont établies au cours de leur développement sous le contrôle de processus complexes incluant la régulation post-transcriptionnelle. Le projet