Projets financés
Assemblage d’un complexe central de la biosynthèse du peptidoglycane de Pseudomonas aeruginosa – BAC-ASSEMBLY
La paroi cellulaire est importante pour la survie et la forme des bactéries, et son mécanisme de biosynthèse est la cible d'antibiotiques tels que les bêta-lactames et la vancomycine. La propagation de souches résistantes a cependant contrecarré l'utilité de ces médicaments et appelle à des efforts
Vers la cause racine d'Alzheimer : le rôle des facteurs d'assemblage du complexe mitochondrial I – MitoCompAs
Les mitochondries coordonnent des fonctions centrales dans la cellule et jouent un rôle crucial dans le métabolisme énergétique. La ?-oxydation des acides gras (FAO) et la phosphorylation oxydative (OXPHOS) sont des processus redox entraînés par des complexes de protéines mitochondriales pour génére
Senseur de force pour mesurer l'oligomérisation des protéines membranaires – Oligo-Force-Sensor
Contexte scientifique. L'oligomérisation de protéines membranaires est nécessaire pour la signalisation et le trafic dans les tissus sains ou malades. De nombreux travaux théoriques ont ?été?consacrés à déterminer les mécanismes physiques qui conduisent à ce processus, en particulier les interaction
Une étude multi-échelle des changements architecturaux et de dynamique du nucléoïde induits par le stress – NUC-STRESS
La capacité de survie d'un organisme dépend, du moins en partie, de sa capacité à percevoir et à répondre à des changements soudains dans son environnement. Cela est particulièrement vrai pour les bactéries, qui ont conçu un large éventail de stratégies pour répondre au stress, y compris la capacité
Deìcryptage du meìcanisme moleìculaires aÌ la base de l'activation des pili de Type IVa – PILACT
Chez les organismes vivants, la migration cellulaire sur surface est essentielle pour l'exploration de l'environnement, le développement multicellulaire, ainsi que la dissémination de cellule cancéreuse. Chez les bactéries, la migration cellulaire sur surface est liée au Pili de Type-IV (Tfp). La mo
Décryptage des mécanismes moléculaires des nouvelles voies d’endocytose en physiologie et pathologie – FLOTAKE
L'endocytose est le mécanisme général par lequel les cellules internalisent les micronutriments et les récepteurs de la surface cellulaire. Ce processus est utilisé par les virus, les toxines et les bactéries pour entrer dans la cellule hôte. Plusieurs voies d’endocytose existent, la voie canonique
Interaction de l'Ub-ligase HERC2 avec les RhoGEFs DOCKD: études structure-interactome-fonction et implication dans la synaptogénèse et des syndromes du neurodéveloppement. – HERC2-DOCKD-Modul
Lors de la synaptogénèse, des Rho GTPases et leurs protéines activatrices RhoGEFs initient et régulent la morphogénèse des épines dendritiques, souvent altérée dans les troubles du spectre autistique (TSA) et la déficience intellectuelle (DI). Nous avons établi un lien fonctionnel entre les RhoGEFs
Étude de la structure, des rôles biologiques et des mécanismes d'action des macro-complexes de CHIKV constitués de protéines non structurelles – CHIK-MaC
Le virus du chikungunya (CHIKV) est un alphavirus transmis par les moustiques qui est réapparu dans de nombreuses régions d'Afrique, d'Asie et d'Amérique, provoquant des épidémies à grande échelle au cours des dernières décennies. Le CHIKV est reconnu comme un problème de santé publique important, e
Miroir Miroir : Exploration catalytique de l’hydrolyse d’énantiomères de glycanes d’intérêts biotechnologiques issus de parois d’algues rouges – Mirror_Mirror
Les algues rouges possèdent des galactanes sulfatés (carraghénanes ou agars) dans leur paroi. Le sucre bicyclique 3,6-anhydro-D-galactose est présent dans les carraghénanes, son énantiomère, le 3,6-anhydro-L-galactose, dans les agars. Le pont 3,6-anhydro introduit des contraintes structurelles stric
Rôle des membranes associées aux mitochondries dans la formation des gouttelettes lipidiques – MADE
Le trafic lipidique non vésiculaire aux sites de contact membranaires (SCM) est un mécanisme clé permettant de préserver l’identité membranaire d’organites tels que la mitochondrie (Mito) ou les gouttelettes lipidiques (GL) exclues de la voie vésiculaire. Les mitochondries (production d’énergie) et
Etude de l'assemblage et du fonctionnement du système de sécrétion de type IV des éléments integratifs et conjugatifs – FUN-ICE
L'émergence et la propagation des résistances aux antibiotiques sont des phénomènes naturels qui résultent de l'adaptation des bactéries à l'exposition aux antimicrobiens. Au cours des dernières décennies, l'utilisation inappropriée des antibiotiques en médecine humaine et vétérinaire a accéléré ces
Développement de la première protéine fluorescente infrarouge émettant au-dessus de 800 nm – InfraredFP800
L’imagerie cellulaire de fluorescence a bénéficié de la révolution de la GFP (Green Fluorescent Protein) au début des années 90 et a vu le développement de fluorophores codés génétiquement couvrant l’ensemble du spectre visible. 15 ans plus tard, une autre famille de protéines fluorescentes (FP) a é
Les céramidases comme nouvelles cibles des médicaments : découverte de ligands et analyses fonctionnelles guidées par la modélisation moléculaire – CERAMM
Le plus grand défi de la R&D de l'industrie pharmaceutique est la validation préclinique des cibles des médicaments. Une cible mal sélectionnée, souvent due à de mauvaises sondes utilisées dans les tests de validation de cible, est la principale source d'échec dans le développement de médicaments. C
Approches RMN innovantes pour l'étude de larges complexes protéine-acide nucléiques – NucleoproteinFastMASNMR
Les interactions des protéines avec les acides nucléiques sont centrales dans une grande variété de processus biomoléculaires. Cependant, les complexes protéine/acide nucléique entiers sont difficiles à étudier, en raison de leur comportement souvent hétérogène et/ou dynamique, ce qui empêche leur c
Analyse structure-fonction du role de la 2'-O-méthylation des ARNr au cours de l'initiation de la traduction sur le ribosome humain – CRYOMETH
Au cours de l'initiation de la traduction, les ARNm se lient aux ribosomes et participent directement à la régulation de la synthèse des protéines. Tandis que l'initiation de la traduction chez se fait principalement par un processus dépendant de la coiffe, 10% des ARNm humains, codant pour des régu
Development de la nano-cristallographie sérielle sur la base de nano-cristaux formés in vivo – SNaX
La diffraction électronique sérielle (SED) et la nano-cristallographie sérielle au synchrotron (nano-SSX) sont deux méthodes émergentes de la biologie structurale dans lesquelles les données sont collectées à partir de nanocristaux de protéines, grâce à des nano-faisceaux d'électrons ou de rayons X,
Caractérisation des complexes macromoléculaires médiateurs des effets des glucocorticoïdes dans les muscles squelettiques – MYOGLUCO
Les glucocorticoïdes (GC) qui sont majoritairement prescrits pour les affections inflammatoires chroniques, dont la polyarthrite rhumatoïde, la sclérose en plaques et l'asthme, ont révolutionné le domaine de la médecine. Cependant, les traitements à long terme ont des effets secondaires importants t
Mécanismes d'inhibition du ribosome par les antibiotiques contexte-dépendants – RibioTiX
Le ribosome bactérien est une cible majeure des antibiotiques. Bien que les antibiotiques qui ciblent le ribosome aient généralement été considérés comme des inhibiteurs généraux de la traduction qui empêchent la synthèse de toutes les protéines avec la même efficacité, une vision plus nuancée de l'
révéler le mécanisme de fonctionnement d'un transporteur de multiples drogues de Streptococcus pneumoniae impliqué dans la RésIStancE aux fluoroquinolone – Multidrug-RISE
Les transporteurs de multiples drogues sont des acteurs essentiels de la résistance aux antibiotiques. Malgré une meilleure compréhension de leur mécanisme d’action, comment ces transporteurs fonctionnent in vivo (en fonction de la biodisponibilité des drogues dans la bactérie) et quel est leur méca
Une bonne compréhension de la synthèse et du rôle de la modification post-traductionnelle « glutaminylation » – Q-TEF1
Les modifications post-traductionnelles fournissent aux protéines un répertoire étendu pour moduler leur stabilité et leur fonction. Une nouvelle modification du facteur d'élongation de la traduction eEF1A: la glutaminylation d'un seul glutamate, a été décrite récemment. Les mécanismes de synthèse,
Étude Structurale et Fonctionnelle du Complexe co-activateur ATAC humain – ATAC
L'initiation de la transcription est une étape majeure de la régulation de l'expression des gènes eucaryotes. L'ADN des cellules eucaryotes est organisé en chromatine, un polymère hautement conservé qui contrôle de nombreuses fonctions du génome. L'accessibilité de l'ADN à la machinerie transcriptio
Mécanismes de photocommutation et dépendances environnementales des marqueurs protéiques fluorescents – Photoswitch-NMR
Les marqueurs protéiques fluorescents photocommutables constituent des outils essentiels pour un large éventail d'applications en microscopie de fluorescence avancée, telles que la microscopie super-résolution et la microscopie multiplexée. Un défi majeur pour l'utilisation optimale de ces molécules
Contrôle cellulaire de l'instabilité struturale des microtubules – MiStIn
Les microtubules (MTs) sont essentiels pour diverses fonctions cellulaires qu'ils assurent grâce à leur instabilité dynamique. Nous avons récemment développé une nouvelle méthode basée sur la cryo-tomographie électronique double axe et le moyennage segmenté de sous-tomogrammes, et avons montré que l
Bases structurales de la glycoprotéine du virus de la rage et des Lyssavirus – GRLy
Les lyssavirus (LYSV) sont des virus enveloppés de la famille des Rhabdoviridae. Ils causent des encéphalites mortelles. Le virus de la rage (RABV), le plus connu du genre, est responsable de 59 000 décès par an. Les lyssavirus sont suffisamment divergents pour échapper à la réponse immunitaire indu
Mécanisme de signalisation lysosomale par un transcepteur d'acides aminés – LYSOSIG
Outre leur rôle dans la dégradation des macromolécules et organites, les lysosomes agissent comme des centres de signalisation qui détectent et transduisent des signaux internes, tels que les niveaux d’acides aminés, pour coordonner des réponses cellulaires. Un exemple bien caractérisé est l'activat
Structure de la machine de réplication de l'ADN des poxvirus par cryo-microscopie électronique – PoxRep
Nous proposons d'élucider la structure et la fonction de la machinerie de réplication de l'ADN des poxvirus par cryo-microscopie électronique (cryo-EM). La famille des poxvirus comprend des membres ayant un fort risque zoonotique, tels que la variole du singe, qui entraîne des épidémies locales en A
Elucidation du mécanisme d'assemblage des clusters Fe-S et de sa régulation par la frataxine – FESAM
Les centres fer-soufre (Fe-S) sont des cofacteurs de protéines intervenant dans une myriade de processus biologiques essentiels. Ils sont synthétisés par des machineries multi-protéiques très conservées via un processus séquentiel dont la plupart des étapes sont encore inconnues. En raison du rôle i
Identification, Architecture, Evolution et Adaptation d'un complexe membranaire du T6SS unique chez Bacteroidetes – CAMELEON
Le phylum Bacteroidetes est un membre dominant du microbiote intestinal humain, où il joue un rôle clé dans la régulation de sa composition et le maintien d'une bonne santé. Beaucoup de ces bactéries abritent un système de sécrétion de type VI (T6SSiii) qui délivre des effecteurs protéiques à d'autr
temporel de Rac1 par son régulateur atypique Bcr à la périphérie de la membrane – BiRaC
Les cellules établissent un réseau spectaculaire de protéines qui leur permet de recevoir et de traiter des signaux. Parmi les protéines essentielles orchestrant la signalisation, la famille des petites GTPases joue un rôle central en fonctionnant comme des interrupteurs moléculaires qui alternent e
Études structurales du complexe d'entrée des poxvirus – POXFUSION
L'entrée des virus enveloppés se fait par la fusion des membranes virales et cellulaires, une étape critique de l'infection qui fournit des cibles pour les vaccins et les thérapies. La fusion virale est catalysée par une protéine spécifique appelée la protéine de fusion, qui s'associe à d'autres pro
Méthylation des microtubules par les méthyltransférases à domaine SET – MICROMETHYL
L’hétérodimère alpha-béta de tubuline est la protéine constitutive des microtubules. L’hydrolyse de la molécule de GTP liée à la sous-unité béta qui accompagne l’assemblage rend les microtubules intrinsèquement dynamiques. Cette dynamique est régulée dans la cellule par différentes familles de proté
Elucider le mécanisme de résistance bactérienne à l'argent en combinant des méthodes biophysiques et des simulations dynamiques hybrides innovantes – Resist2Silver
Les propriétés antimicrobiennes de l’argent sont utilisées depuis des siècles. Cependant, son mode d’action et sa toxicité envers les bactéries restent inconnus. De manière similaire à la résistance aux antibiotiques, les bactéries Gram-négative ont su développer un mécanisme permettant de se débarr