Projets financés
Dynamique de la chromatine et transcription durant la mitose dans les cellules souches mammifères
La mitose a depuis longtemps été associée avec un arrêt de la régulation génique : l’enveloppe nucléaire est désassemblée, la chromatine se condense, de nombreux facteurs de transcription (TFs) sont inactivés, et la transcription est globalement atténuée. Les mécanismes réactivant les programmes gén
Les complexes CyclinA2-Cdk1/2 : du contrôle temporel de la réplication de l’ADN à l’adaptation au checkpoint et à l’entrée en mitose en conditions de stress.
Le maintien de l'intégrité du génome, de l'identité et du devenir des cellules dépend de l'exécution correcte et ordonnée de la réplication de l'ADN et de la ségrégation des chromosomes en mitose au cours des générations successives. La duplication de grands génomes pose des problèmes spécifiques en
Etapes initiales de la synthèse de la grande sous unité ribosomique eucaryote
Le ribosome catalyse la synthèse de la liaison peptidique durant la traduction. Le ribosome est constitué d’une petite et d’une grande sous unité, chacune possédant un squelette d’ARN sur lequel sont fixées des protéines ribosomiques (PR). Le ribosome est un ribozyme car son centre catalytique, port
Méthylation des ARNr: Bases Moléculaires et Impact sur l’activité traductionnelle du ribosome
L'assemblage des ribosomes et la régulation de l'activité de traduction sont cruciaux pour la croissance cellulaire et la réponse aux signaux externes ou aux conditions environnementales dans tous les organismes eucaryotes. L'ARN ribosomique (ARNr) est le pivot de l'assemblage et de la fonction d
Role des G-quadruplexes dans la régulation transcriptionnelle
Les G-quadruplexes (G4s) sont des structures non canoniques des acides nucléiques, extrêmement stables et bien caractérisées in vitro. Dans le cas de l'ADN, elles représentent une alternative à la double-hélice B. Les séquences susceptibles d’adopter cette conformation sont sur-représentées dans des
Régulation redox de la réponse aux stress biotiques et abiotiques médiée par les petits ARNs
Les contraintes environnementales telles que l'augmentation de la température et les infections virales ont des impacts majeurs sur les organismes vivants. Les plantes, comme d'autres espèces, développent divers mécanismes pour faire face aux effets de ces stress sur la croissance et la survie. L'ho
Reconstruire l’évolution des structures crânio-dentaires chez l’humain
La compréhension des relations entre génotype et phénotype permettra de jeter une lumière nouvelle sur l’étude du registre paléoanthropologique. Le projet GenoMorph repose sur une approche multidisciplinaire exploitant données (paléo)génétiques et morphologiques issues de techniques d'imagerie par r
Modulation du Taux de Mutation pendant l'Infection et Conséquences Evolutives
Nos principaux objectifs sont - caractériser l'occurrence des mutations dans les génomes des phages au cours de l'infection - d'étudier les mécanismes expliquant les taux de mutation élevés des phages - déterminer comment l'infection affect le taux de mutation des cellules hôtes et affecte leur c
Etude de la fonction des condensines: du contrôle de la structure du chromosome au maintien de la stabilité génétique
Réplication et ségrégation de l’ADN sont des étapes clés de la division cellulaire. Tout au long de ces processus, le maintien de la structure chromosomique est essentiel à la bonne transmission du matériel génétique. Parmi les différents facteurs qui contrôlent la structure de la molécule d’ADN, le
Séparations de phase induite par le stress dans le contrôle de l’expression des ARNs, fitness et évolution adaptative
Nous proposons donc de (1) tester si les séparations de phase module l’expression des ARN en réponse aux variations de températures, (2) tester si la variation génétique naturelle qui contrôle la sensibilité de ces séparation de phase aux changements de températures est adaptée aux niches écologiqu
Caractérisation fonctionnelle de facteurs impliqués dans l’interférence génétique
La recombinaison homologue est essentielle pour maintenir la stabilité du génome et pour donner accès à la redondance de l'information génétique qui existe sous la forme des chromatides sœurs ou des chromosomes homologues lorsque les deux brins de la double hélice de l'ADN sont cassés et pour génére
Mécanismes de répression des ET basés sur l'organisation chromatinienne – COMETES
Les éléments transposables (ET) constituent une large fraction des génomes eucaryotes mais leur mobilité est une menace pour le génome hôte. L'un des grands défis scientifiques est de déterminer comment les modifications chromatiniennes induisant la répression des ETs sont établies et maintenues. Vu
Role évolutif de l’héritage génomique archaique dans la diversité humaine unique de Mélanésie – PapuaEvol
Une grande partie de notre génome ne vient pas d’Homo sapiens mais de lignées aujourd’hui éteintes d’anciens homininés. Ce projet vise à étudier le caractère fonctionnel de cet exceptionnel héritage biologique au sein de la diversité humaine, unique, de Nouvelle Guinée. Le génome de ces populations
Rôle des ARN régulateurs dans l’adaptation de Staphylococcus aureus aux stratégies immunitaires dépendantes des métaux
Staphylococcus aureus est un pathogène majeur de l’Homme, responsable d’un large éventail d’infections nosocomiales et communautaires allant d’infections bénignes à de graves infections systémiques. La propagation de souches hypervirulentes et multirésistantes aux antibiotiques est d’autant plus ala
Revisiter le cycle de vie de la levure bourgeonnante
La levure de boulanger Saccharomyces cerevisiae sert de modèle d’étude du cycle de vie eucaryote depuis près d'un siècle. Ce cycle de vie comprend une alternance entre une phase diploïde et une phase haploïde. Les cellules diploïdes prolifèrent par mitose dans des conditions riches en nutriments et
Microcorie congénitale une maladie rare modèle pour l'étude du développement oculaire et du glaucome
La microcorie congénitale (MCOR) est une maladie rare dominante autosomique caractérisée par des micropupilles aréactives en raison d'une absence de muscle dilatateur de l'iris. Un glaucome et une myopie sont très fréquemment associés. Nos travaux ont révélé que cette maladie s'explique des mécanism
Fonctionnement et dysfonctionnement du facteur de transcription/réparation de l'ADN TFIIH
Des réseaux complexes de régulation de gènes régissent le développement des organismes et leur homéostasie. Le dysfonctionnement de ces réseaux affecte des fonctions cellulaires fondamentales, conduisant alors à de nombreuses maladies humaines La caractérisation des complexes impliqués dans ces voie
Facteurs déterminants de la régulation transcriptionnelle par les complexes co-activateurs
La transcription requiert les activités coordonnées de co-activateurs modifiant ou remodelant la chromatine. Malgré l'avènement de la génomique fonctionnelle, il est toujours aussi difficile de comprendre comment ces facteurs établissent des profils d’expression spécifiques, probablement parce que n
Chromatine et évolution des génomes
Le rôle essentiel de la chromatine dans l'organisation fonctionnelle et l'expression du génome a été largement inexploré dans les études évolutives. En effet, la structure chromatinienne est beaucoup moins traçable que les séquences codantes au cours de l'évolution. Nous avons développé un modèle ph
Fonction du complexe RPA (Replication Protein A) dans le maintien des télomères et la stabilité du génome, implication dans les fibroses pulmonaires et les téloméropathies
Les télomères sont des séquences répétées aux extrémités des chromosomes qui assurent la stabilité du génome. Un raccourcissement prématuré de ces séquences est à l’origine de téloméropathies comme la Dyskératose Congénitale, l’anémie aplasique et les fibroses pulmonaires idiopathiques (IPF). Des va
Elucidation du rôle régulateur de l’extension N-terminale de POLRMT dans l’expression des gènes mitochondriaux chez les mammifères
Les dysfonctions mitochondriales jouent un rôle crucial dans les pathologies métaboliques et neurodégénératives, le cancer et le vieillissement. En effet, les mitochondries sont des organites essentiels des cellules eucaryotes : elles permettent de fournir la majeure partie de l’énergie cellulaire g
Elucidation du silencing aux nouvelles séquences d’ADN : intérêt pour l’amélioration des plantes par utilisation de transposons
Les éléments transposables (ET) constituent une grande proportion des génomes eucaryotes. En raison de leur propension à se multiplier et à se déplacer, les ET représentent à la fois un moteur de l'évolution des génomes et une menace pour leur intégrité. Ainsi, la compréhension des mécanismes de rép
Evolution de la régulation d'expression génique
La régulation de l’expression génique en fonction de l’environnement, une propriété aussi appelée plasticité d’expression, est fondamentale pour l’adaptation des êtres vivants dans un monde en perpétuel changement. Bien que de nombreux mécanismes moléculaires impliqués dans la régulation d’expressio
Rôle de la lysine méthyltransférase PR-Set7/SET8 et de ses substrats non-histone dans la régulation de l'expression des gènes
La méthylation des histones par les lysine-méthyltransférases est connue pour réguler les fonctions de la chromatine. Cependant, ces enzymes ont également d'autres substrats protéiques, étendant ainsi leurs fonctions cellulaires au-delà de leur capacité à modifier les histones. Identifier ces substr
Characterisation de l'expression des clusters de piARNs au cours du développement et de leur capacité à apprivoiser une activité soudaine d'élément transposable
Les génomes eucaryotes sont majoritairement composés de séquences répétées et notamment d’éléments transposables (ET), séquences d’ADN mobile hautement mutagène qui constituent une menace sévère pour le maintien de l’intégrité des génomes. Ces ETs résident dans le génome de toutes les espèces et rep
Apprendre des conflits : inhibition fréquente de la transformation naturelle par les éléments génétiques mobiles
L'objectif du projet TransfoConflict est d'étudier à grande échelle les variations de fréquences de transformation de deux espèces de bactéries et afin d'en identfiier, pour la première fois, les causes et conséquences. En interprétant ces résultats à la lumière des interactions antagonistes entre l
Perte de fonction de MBNL et dysfonction de l'unité motrice dans la dystrophie myotonique
La dystrophie myotonique de type 1 (DM1) est une maladie neuromusculaire à gain de fonction de l’ARN due à l’expansion anormale du triplet CTG dans le 3’UTR du gène DMPK. Les ARN mutés s’agrègent dans le noyau et séquestrent les protéines liant l’ARN de la famille MBNL conduisant à de nombreuses ano
Méthylation m6A des ARN: une nouvelle voie de contrôle des rétrovirus endogènes
Les rétrovirus endogènes (ERV) forment un groupe hétérogène de rétrotransposons qui occupent 10% du génome de la souris et de l’homme. Au cours de l’évolution, les ERV ont été une source importante et bénéfique d’innovations génétiques. Cependant, à court terme, les ERVs peuvent compromettre l’intég