Projets financés

La prédiction en structure secondaire constitue une étape essentielle de la modélisation des architectures adoptées par les Acides RiboNucléiques (ARN). Des progrès récents des techniques de sondage haut-débit de l’ARN ont permis le développement de méthodes prédictives in silico, informées par des

À un niveau macroscopique, le transfert d'informations dans le cerveau humain résulte à la fois de connexions à courte portée entre des zones adjacentes et de connexions à longue portée entre des zones éloignées. Il est envisagé qu’un déséquilibre entre les connections à longue distance et à courte

1. Développer un nouveau cadre computationnel pour construire des réseaux multicouches intégrant différents réseaux basés sur la connaissance et des réseaux expérimentaux. 2. Développer des solutions informatiques de pointe exploitant la topologie multicouche pour améliorer la puissance de l'analys

L'objectif central de cette proposition est de fournir un moteur de recherche ultra rapide et convivial qui compare une séquence d'interrogation, typiquement une lecture ou un gène (ou un petit ensemble de telles séquences), à l'ensemble exhaustif de toutes les données disponibles correspondant à un

Notre projet aborde les questions de la prédiction et de la conception des fonctions enzymatiques. Pour ceci, nous étudions une famille d’hydroxylases (les monooxygénases à flavine, FMO) capables d’effectuer leur réaction (une hydroxylation) à différentes positions du cycle aromatique de l’ubiqui

Ce projet a pour but de contribuer à ce problème majeur de santé publique, avec les deux objectifs suivants : 1. Évaluer l'impact de la fibrose préopératoire sur le remodelage ventriculaire gaucheaprès chirurgie de réparation mitrale dans une étude clinique impliquant 15 patients. 2. Concevoir de

Il existe de plus en plus de preuves expérimentales chez la drosophile que l'architecture et l'organisation du génome ont une pertinence fonctionnelle réelle, à la fois à partir de la biochimie de masse et de l'imagerie en direct de loci individuels. Notre travail théorique suggère que l'évolution a

Ce projet se situe dans le contexte de la biologie structurale, où la géométrie des distances (DG) s’est révélée être un outil pertinent pour l'analyse et la détermination de structures biologiques, telles que les protéines. L'utilisation classique de DG se situe dans le cadre des expériences de rés

Le projet TOPACS vise l'analyse à grande échelle d'images 3D stockées dans les hôpitaux. L'objectif principal final est une étude à grande échelle de l'anatomie Humaine (anatomie computationnelle). Le défi principal de ce projet est la grande quantité de données à traiter, et une contrainte forte es

Le but de ce projet est le développement d'une expertise théorique indépendante sur le forçage génétique synthétique. Il est essentiel que la recherche sur le forçage génétique soit aussi menée par des chercheurs non impliqués dans le développement de la technologie et le déploiement d'allèles forc

Développement d'un modèle mathématique de la transduction de signal et de l'adaptation dans les cônes chez les mammifères Les yeux de la plupart des vertébrés possèdent deux types de photorécepteurs : les bâtonnets pour la vision nocturne et les cônes pour la lumière diurne et les couleurs. Contr

Le système immunitaire s'appuie sur son répertoire diversifié de récepteurs spécifiques des cellules B et T (BCR et TCR) pour reconnaître la grande diversité des antigènes dérivés des agents pathogènes. La composition des répertoires BCR et TCR porte l'empreinte des réponses immunitaires passées et

SulcalGRIDS aims at elaborating a new model of cortical morphogenesis that could explain how the human cerebral cortex shape complexity emerges during development. Such a model would be instrumental to develop novel biomarkers of early atypical development and to better understand the pathophysiol

Ce projet a pour but le développement de MinOmics, une chaîne de traitement d'analyse et de visualisation dédiée à l’analyse multi-omique et utilisé comme cas d’étude pour l’exploration des réseaux de signalisation redox. Nous proposons une méthode d’analyse visuelle et interactive des résultats et

La structure 3D des chromosomes est finement organisée pour assurer les fonctions biologiques majeures comme la réplication, la régulation transcriptionnelle. Pour l’étudier en détail, se développent en parallèle de la microscopie, des techniques dites de contacts (3C, Hi-C) qui piègent des fragme

L'hétérogénéité au sein d’une population de cellules influe sur l'organisation des assemblages multicellulaires dérivés d'un processus d'agrégation. Les propriétés concernées sont en particulier la stabilité, la taille et la composition des groupes. L'assortiment différentiel peut entraîner une conc

Pour relever ce défi, nous poursuivrons trois objectifs : 1) Applicatif, en développant deux applications de biologie expérimentale pour lesquelles l’utilisation de SAMic est obligatoire. 2) Technologique en concevant le module smartCam-LEAD (Localised Events Advanced Detector). 3) Preuve de con

Le projet vise à revisiter la représentation des maladies à partir de l’imagerie médicale, et ainsi améliorer le suivi et la stratification de risque à la fois pour des individus et des groupes de patients. Il propose d’abord de revisiter les approches d’intégration de données en prenant en compte u

L'imagerie de rehaussement tardif au gadolinium (LGE) a été largement utilisée pour la détection et l'évaluation des cicatrices myocardiques et de la fibrose en imagerie par résonance magnétique cardiaque (IRM). C’est un standard de référence pour la quantification de la fibrose focale du myocarde,

Reconstruire l'histoire évolutive des organismes est une étape cruciale vers la résolution des grandes problématiques biologiques. Les relations entre espèces sont traditionnellement représentées sous la forme d'arbres phylogénétiques. Cependant, ces arbres ne peuvent pas représenter des évènemen

Les méthodes d'évolution moléculaire sont confrontées à un problème de validation : il n'est pas possible de voyager dans le temps et de vérifier des hypothèses et des prédictions, qui concernent des événements pouvant aller jusqu'à 4 milliards d'années. Dans toute la littérature scientifique, l'app

Les objectifs initiaux du projet consistaient à développer un cadre méthodologique et informatique pour l'application efficace de l'apprentissage fédéré dans le domaine de la santé, avec un accent particulier sur les applications d'imagerie médicale. Du point de vue méthodologique (WP1), la proposi

Les poumons sont les principaux organes du système respiratoire chez l'homme et chez de nombreux animaux. Ils sont responsables des échanges gazeux entre l'air et le sang par le biais d'une ventilation mécanique. Ils possèdent une architecture extraordinairement complexe, avec la structure fractale