Projets financés
Régulation génétique et épigénétique du cycle de vie de l'algue brune Ectocarpus – Epicycle
L'objectif du projet Epicycle est d'élucider les processus génétiques et épigénétiques associés à la progression du cycle de vie et au déploiement du programme de développement des sporophytes dans l'algue brune modèle multicellulaire Ectocarpus. Le projet combine une caractérisation moléculaire dét
Architecture génétique de la tolérance au déficit hydrique chez une espèce fruitière pérenne (V. vinifera) – G2WAS
Chez les espèces pérennes, le rendement et la qualité de la production sont affectés par la contrainte hydrique avec des effets interannuels marqués. Nos connaissances sur les mécanismes physiologiques et la variabilité génétique de ces réponses restent insuffisantes pour adapter les vignobles aux b
Le rôle des systèmes du transport membranaires fongiques induits par la symbiose ectomycorhizienne – MYCOTRANS
Plusieurs études transcriptionnelles ont révélé l’induction de systèmes de transport membranaire fongiques dans les mycorhizes, impliqués dans la nutrition K, N et P ; mais étonnamment, un membre de la famille CDF (Facilitateur de Cation Diffusion) a été identifié comme étant le transporteur le plus
Identifier l’interrupteur moléculaire de la tolérance à la dessiccation des graines pour améliorer la tolérance des plantes aux stress – DEswitch
Le projet DEswitch vise à élucider le mécanisme d’activation/inactivation aboutissant à la tolérance à la dessiccation. voir Production scientifique Validation fonctionnelle d'une liste de genes candidats potentiellement impliques dans la régulation de la tolerance a la dessiccation Malabarba J., Wi
Suivi in vivo de la reprogrammation rhizobienne lors de la colonisation racinaire: de la rhizosphère à un mode de vie confiné dans la plante – Live-Switch
Live-Switch vise à suivre avec une résolution cellulaire la colonisation précoce des racines de l'hôte par des bactéries utilisant des voies d'entrée transcellulaires ou intercellulaires. En tirant parti de systèmes de légumineuses modèles complémentaires, Medicago et Lotus, le projet combinera l'im
Analyse de la dynamique chromatinienne d'un champignon pathogène pendant l'infection – CHOPIN
Pendant l’infection, les agents pathogènes, dont les champignons, sécrètent un arsenal de molécules, appelées effecteurs, éléments clés de la pathogénie. Leptosphaeria maculans, agent de la nécrose du collet du colza, infecte son hôte en deux étapes : une étape précoce sur jeunes feuilles de colza à
L’étude du développement des nectaires et la sécrétion du nectar pour l’amélioration de la survie des insectes pollinisateurs et la pollinisation chez les cucurbitacées – NECTAR
Le projet NECTAR relève le défi d'améliorer la compréhension actuelle du développement de la glande nectaire et de la sécrétion de nectar en relation avec l’activité de butinage par les pollinisateurs, des caractères clés qui ont un impact sur la stabilité des rendements et la disponibilité de la no
Comprendre l'EVOlution des biopolymères structurant les BARrières apoplastiques protectrices des plantes par l'élucidation des voies métaboliques associées – EVOBAR
La colonisation des terres par les plantes, il y a environ 500 millions d’années, a constitué une étape décisive de la terraformation, ouvrant la voie à l’élaboration d’écosystèmes terrestres complexes et à l’apparition de nouvelles formes de vie. Lors de cette transition du milieu aquatique vers le
Production de véritables lignées pluripotentes porcines: une étape clé pour le phénotypage moléculaire à grande échelle des caractères agronomiques – PluS4PiGs
Les changements globaux actuels (réchauffement climatique, disponibilité des ressources agricoles, perception sociétale de l'élevage, importance sanitaire des zoonoses) nous obligent à repenser nos systèmes de production. La pression des productions animales sur les écosystèmes doit être réduite, la
Remodelage chromatinien dans la régulation de Crossing-Over méiotique et la production des graines – ChromCO
Des études intensives antérieurs ont permis d’isoler nombreux gènes impliqués dans la méiose chez la levure, les plantes et les animaux. Au niveau de la molécule d’ADN, la formation de Double-Strand-Breaks (DSBs), la recombinaison homologue et la formation de CO sont assez bien compris. Cependant, a
Mécanismes moléculaires de détection de la température chez les plantes – TEMPSENS
Les objectifs initiaux du projet étaient la production et la purification de différentes constructions d'ELF3, en particulier la région du domaine de type prion (PrD), qui est essentielle pour la séparation de phase liquide-liquide (LLPS). Les objectifs pour les 18 premiers mois du projet se concent
Elucidation des gènes spécifiques de la photosynthèse chez les diatomées – BrownCut
Diatoms are a major group of unicellular photosynthetic eukaryotes in aquatic environments. Evolutionarily, these algae are only distantly related to green algae and plants. Whilst these latter organisms are derived from the primary endosymbiosis of a cyanobacterium into a phagotrophic eukaryote, di
Déchiffrer toute la complexité du syndrome de mortalité des huîtres du Pacifique pour modéliser le risque épidémiologique. – DECICOMP
Depuis des décennies, C. gigas a connu des épisodes de mortalité, mais le phénomène s’est considérablement aggravé depuis la fin des années 2000. Les épizooties affectent principalement les huîtres juvéniles, décimant jusqu'à 100% des jeunes huîtres dans les fermes ostréicoles françaises. Ces derniè
Mécanismes d'adaptation chez les Penicilllium utilisés dans les produits fermentés – FUNGADAPT
L’étude de la divergence adaptative est essentielle pour comprendre l’adaptation des organismes à leur environnement et l’émergence de la biodiversité. La domestication est un bon modèle d’étude car elle correspond à une sélection forte et récente sur des caractères connus. Les champignons filamente
Vers un modèle intégratif de la bicouche lipidique de la membrane plasmique végétale – PLAYMOBIL
L’élucidation des bases moléculaires de l’organisation de la membrane plasmique apparaît nécessaire pour comprendre la manière dont les plantes s’adaptent aux modifications environnementales. Un point crucial à cet égard concerne l’asymétrie entre les deux feuillets de la MP et leur couplage, act
Modulation des réseaux de genes controllant la robustesse phenotypique de l'immunité quantitative des plantes – PRobIty
Notre hypothèse clé est que la robustesse de la QDR émerge à l'échelle globale de l'architecture des réseaux de gènes des plantes et des pathogènes, et implique des gènes conservés ayant des fonctions moléculaires diverses. La raison d'être de cette recherche est basée sur nos résultats préliminaire
L’étoffe d’un pathogène : comment Xanthomonas s’adapte à la vie in planta – XBOX
Les agents phytopathogènes menacent la qualité des aliments, la santé humaine, l'économie, les sociétés et les écosystèmes. Ces interactions biotiques reposent sur des réseaux de réponse complexes. Nous devons comprendre la structure et la dynamique entre le pathogène et son hôte à différents niveau
Gynogenèse in vivo chez le maïs : nouvelles connaissances sur la double fécondation chez les plantes – NOT-LIKE-DAD
La reproduction sexuée représente un processus clé dans le succès évolutif des organismes eucaryotes. Chez les plantes à fleur, cette reproduction sexuée est caractérisée par un processus unique appelé double fécondation. Celui-ci implique la fusion séparée et simultanée de deux cellules spermatique
Adaptation des champignons au fromage – ArTIFICE
Pour déterminer si l’évolution est répétable ou contingente, il faut étudier des adaptations parallèles (des évènements indépendants d’adaptation à la même niche écologique). Les champignons du fromage sont d’excellents modèles pour ce genre d’étude car plusieurs espèces ont été sélectionnées par l’
Analyse du compromis croissance/défense chez le blé dur – TRADEOFF
Ce projet vise trois objectifs: (1) Tout d'abord, nous posons l'hypothèse qu'il existe des conditions où la croissance et la défense peuvent être optimisées. Notre premier objectif est de mieux comprendre, en conditions contrôlées, la relation entre la croissance et la défense déclenchée par différe
Bases moléculaires de l'adaptation des plantes à la carence en manganèse – DEFIMAN
Le manganèse (Mn) est un nutriment précieux pour les plantes qui l’utilisent comme cofacteur enzymatique. Le Mn est associé au centre actif du photosystème II (PSII) et à la superoxide dismutase, et peut donc impacter des métabolismes cellulaires centraux comme la fixation du CO2 ou la réponse antio
Nanodomain membranaire: un role dans la signalisation osmotique – CellOsmo
Les changements climatiques, la croissance démographique mondiale et la raréfaction des terres arables imposent de fortes contraintes sur les écosystèmes. La biodisponibilité en eau est un cas révélateur de cette situation. Durant les prochaines décennies, il sera nécessaire d’adapter la production
Les transporteurs d'acides aminés cationiques chez la truite – CAAT-TROUT
L’impératif d’une aquaculture durable conduit à orienter l’alimentation des poissons vers la substitution de la farine de poisson (FP) par des produits végétaux (PV) moins onéreux et plus écoresponsables. Toutefois, ce remplacement est souvent limité par des niveaux trop faibles en certains acides a
Rôle des modifications épigénétiques et transcriptomiques dans la modification des règles de la recombinaison chez des hybrides interspécifiques: modèle Brassica – STIRRER
La recombinaison méiotique est le principal mécanisme permettant de générer une nouvelle diversité génétique à chaque génération. L’utilisation de ce processus est indispensable pour l’amélioration des espèces cultivées, et notamment pour la création de nouvelles variétés plus respectueuses de l’env
Décrypter l’organisation fonctionnelle de “fabriques métaboliques” inter-règnes dans une endosymbiose d’insecte – FOCuS
Les pesticides sont utilisés de façon intensive contre les insectes ravageurs des cultures, ce qui crée des phénomènes de résistance et affecte l'environnement et les autres organismes, y compris humains. Des alternatives durables pour le contrôle des insectes nuisibles sont donc urgentes. Les cha
Comprendre le mode d'action d'un facteur de transcription pionnier pendant le développement des nodosités symbiotiques – PIOSYM
Dans les noyaux eucaryotes, l'ADN génomique est compacté en s’enroulant autour de tétramères d'histone appelés nucléosomes. La plupart des facteurs de transcription (FT) sont incapables de se lier à leurs séquences cibles en présence de nucléosomes. Cependant, un groupe de FT appelé «pionnier» possè
Etude de l'adaptation à l'hôte chez les Burkholderia symbiotiques et pathogènes des eucaryotes – BURKADAPT
L'agriculture moderne doit faire évoluer ses pratiques pour devenir plus durable et limiter l’utilisation des intrants chimiques. Les inoculants microbiens à base de bactéries aux propriétés promotrices de croissance des plantes figurent parmi les solutions proposées. Des recherches intensives sont
Une approche tridimensionnelle de génomique fonctionnelle pour identifier les cibles contrôlant la réponse au stress thermique chez le blé – 3DWheat
In the 3Dwheat project, we propose to monitor changes in the transcriptome, epigenome and 3D-chromatin structure in wheat in order to obtain a global picture of how changes at the chromatin level are associated with changes in gene expression during heat stress response. Although a thorough descript