Projets financés
Elucidation du réseau d'interactions entre les RNPv du virus influenza A requis pour l'incorporation du génome
Le caractère segmenté du génome des virus influenza facilite leur évolution par réassortiment des ARN viraux (ARNv), mais il complique singulièrement son encapsidation. En effet, une particule virale doit contenir au moins une copie de chaque ARNv pour être infectieuse. Il est admis que chaque ARNv
Rhodopsines virales: Structure, Fonction, et Nouveaux Outils pour l'Optogénétique
Les virus géants ont des génomes et des tailles comparables à ceux de certaines bactéries. Des gènes de rhodopsines ont été identifiés dans des virus géants qui infectent une algue du lac Organic, en Antarctique. On sait que cette algue est une source majeure de sulfure de diméthyle, substance essen
Caractérisation des machineries de réplication de Bunyavirus hautement pathogènes par une approche de biologie structurale intégrée
Les Bunyavirales constituent un large ordre de virus à ARN négatif segmenté comprenant plus de 500 virus classifiés en 10 familles. Retrouvés partout sur la planète, ces virus ont pour réservoir des arthropodes et des rongeurs et sont susceptibles d’infecter l’homme résultant en des maladies de fort
Collision entre moteurs moléculaires et structures G4 seules ou liées à des protéines de liaison observée à l’échelle de la molécule unique en pinces magnétiques
Les structures d’ADN non Watson-Crick de type G-quadruplex (G4) peuvent bloquer la progression de la fourche réplication ou de la transcription. Les séquences pouvant former ces structures sont pervasives dans les génomes, et comprendre leur règle de formation est encore aujourd’hui un challenge. Da
Structure et fonction moléculaire du pseudopilus dans la sécrétion de protéines par lla voiè de type 2
De nombreuses bactéries à Gram-négatif possèdent dans leur enveloppe le système de sécrétion type II (SST2), une machine moléculaire qui leurs permet de larguer des protéines spécifiques dans le milieu de culture. Les protéines sécrétées sont souvent des enzymes lytiques et toxines impliquées dans
Dissection du mécanisme moléculaire d'un transporteur d'antibiotiques
Notre consortium a trois objectifs majeurs. Le premier est de déterminer la structure de BmrA dans plusieurs conformations, par cryo-microscopie électronique et cristallographie aux rayons X. Le second est d'étudier la dynamique conformationnelle de BmrA par 3 techniques: l'échange hydrogène/deutéri
Spectrométrie de masse structurale pour étudier le dialogue entre les mécanismes de régulation des complexes du protéasome
Le protéasome est très divers en termes de composition de sous-unités, de modifications post-traductionnelles et de liaison à différents régulateurs. Le projet ProteasoRegMS propose de développer et d'employer de nouvelles approches basées sur la spectrométrie de masse pour étudier cette diversité d
Organisation et dynamique des faisceaux de filaments d'actine induits par les myosines
L'objectif est d'étudier comment les myosines sont les grands orchestrateurs de l'organisation des faisceaux de filaments d'actine et de la croissance des filaments dans ces structures. En effet, les myosines spécialisées ont une influence directe sur l'initiation et l'organisation des faisceaux d'a
PROTEINES ARGININE METHYLTRANSFERASES : REGULATION, SPECIFICITE ET RECONNAISSANCE DES SUBSTRATS
InSiPRMTs est un projet de recherche fondamentale destiné à aborder plusieurs aspects de la reconnaissance macromoléculaire impliquant les PRMTs pour répondre à trois défis : (i) comprendre comment les PRMT reconnaissent et lient leurs substrats protéiques ; (ii) révéler comment les PRMT réalisent
IntpTN3, une recombinase unique, RecA-inépendante et dirigée par l'homologie: mécanisme, structure, partenaires et applications
Nous avons publié la découverte d'une nouvelle intégrase codée par un plasmide (IntpTN3) de l'archée anaérobie hyperthermophile Thermococcus nautili. En plus des propriétés canoniques d'intégration, d'excision et d'inversion spécifiques de site, cette recombinase à tyrosine affiche des activités san
Imagerie sensible à la phase de nombreux marqueurs réversiblement photocommutables en lumière modulée
La fluorescence est devenue une observable essentielle en biologie et en médecine. La distinction d’un marqueur fluorescent repose généralement sur l’optimisation de sa brillance et de ses propriétés spectrales. En dépit de sa popularité, cette approche souffre cependant de certaines limitations. L'
Coupure des cous membranaires par les ESCRT-III
La machinerie ESCRT (endosomal sorting complex required for transport) catalyse un large éventail de processus physiologiques et pathologiques de remodelage membranaire, y compris le bourgeonnement de vésicules et de virus enveloppés, la division cellulaire et de nombreux autres processus impliquant
Ciblage des protéases ClpP: Dynamique, fonction et modulation allostérique par agents thérapeutiques
Les cellules biologiques réalisent leurs taches fondamentales grâce à l’action orchestrée de nombreuses protéines et assemblages cellulaires. De grands édifices moléculaires sont responsables de la synthèse de produits naturels, de métabolites et de protéines, assistent le repliement ou le dépliemen
Structure, assemblage et propriétés biophysiques des mitofusines
Les mitochondries constituent un réseau dynamique dont la morphologie est conditionnée par un équilibre entre la fission et la fusion de leurs membranes. Ces processus sont essentiels pour le maintien de l’architecture et de toutes les fonctions mitochondriales. Leurs altérations sont donc associées
Décrypter les synthèses d'ARN par les pneumovirus
La famille des pneumovirus contient plusieurs virus infectant les voies respiratoires et induisant des pneumonies et bronchiolites sévères ou mortelles chez l'homme et les animaux. Citons en particulier le virus respiratoire syncytial (VRS) humain, le VRS bovin, le metapneumovirus humain, le metapne
Structure et fonction des toxines de type aerolysine chez le couple hôte/parasite Biomphalaria/Schistosoma
Dans les interactions hôtes pathogènes, de nombreux systèmes de défenses et de virulence se font face. Parmi eux, on retrouve les toxines, largement répandues dans le monde du vivant allant des procaryotes jusqu’aux animaux. Ces dernières ont des actions très diverses en affectant de manière sélecti
Nanosondes pour l'imagerie des synapses en microscopie de super-résolution
Les mécanismes moléculaires qui sous-tendent la majorité des processus cellulaires ont lieu à l’échelle nanométrique. Le développement de la microscopie de super-résolution dans les dix dernières années, a été récompensée par le prix Nobel de chimie en 2014, et permet d’étudier ces mécanismes avec u
Études de la structure et des fonctions des complexes Rea1
Les ribosomes eucaryotes sont des machines moléculaires dont l'assemblage est étroitement contrôlé pour assurer la biosynthèse des protéines. L’assemblage du ribosome est initié dans le nucléole par la transcription et la maturation des ARN ribosomaux formant, avec les protéines ribosomiques, les pa
Décryptage des mouvements moléculaires continus des complexes biomacromoléculaires par de nouvelles méthodes d’analyse d’images de cryo-microscopie électronique
La cryo-microscopie électronique (cryo-ME) est en constant développement pour la détermination en routine de structures (conformations) biomoléculaires à haute résolution. Ce projet est focalisé sur le développement d’approches d’identification des transitions conformationnelles continues à partir d
Organisation supramoléculaire du cycle de Calvin-Benson
Le projet propose de définir dans un organisme unicellulaire modèle, l'algue verte Chlamydomonas reinhardtii, l'ensemble des structures des enzymes de Calvin Benson permettant la fixation de carbone. Outre les structures individuelles nouvellement déterminée pour des enzymes chloroplastiques, le pro
les protéines «Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich», décryptage de leurs structures et activités: une potentielle nouvelle famille de biopesticide comme alternative aux traitements chimiques conventionnels
Nous avons montré qu’une nouvelle classe de protéines riches en cystéines, appelée Bacteriocyte-specific Cystein Rich (BCR) présente une activité insecticide remarquable contre le puceron du pois. Le projet BIOFAMILY poursuit trois objectifs principaux afin d’identifier de nouveaux modes d'action i
Structure et fonction des complexes endogènes contenant TFIID
Pour mieux comprendre le rôle du TFIID natif dans la formation des PIC endogènes et l'initiation de la transcription qui en découle, nous avons les objectifs suivants : caractériser la façon dont TBP est recruté à l'ADN du promoteur ; caractériser la composition et la structure des PIC endogènes con
Détermination de la structure tridimensionnelle des conformations actives et inactives du récepteur V2 de la vasopressine
Le récepteur V2 (V2R) de l'arginine-vasopressine (AVP) est un prototype des récepteurs couplés aux protéines G et il joue un rôle crucial dans le maintien de l'équilibre hydrique de notre organisme. Il est considéré comme un modèle des récepteurs liant les peptides et représente une cible thérapeuti
Le facteur ultraconservé d'assemblage du ribosome qui agit entre les deux sousunités
L’assemblage des ribosomes est assuré par plusieurs facteurs protéiques souvent très conservés. L’un d’entre eux, YBEY, existe chez toutes les bactéries, mais aussi chez plusieurs eucaryotes qui possèdent des organites d’origine bactérienne. Dans tous les systèmes étudiés, YBEY joue un rôle essentie
Bases structurale du système de secretion de type IV d'Helicobacter pylori
Les bactéries ont développé des stratégies remarquables pour coloniser les organes, contre-attaquer et subvertir les défenses de l’hôte. Les systèmes de sécrétions de type IV (T4SS) sont des instruments macromoléculaires utilisés par les bactéries pour transporter diverses macromolécules telles que
Bases structurales des mécanismes de gyration et reverse gyration de l'ADN
Les ADN topoisomérases sont des enzymes essentielles impliquées dans les remaniements de l’ADN lors de la réplication, la transcription, la réparation, la recombinaison, la ségrégation des chromosomes et la stabilité des génomes. Si la plupart des topoisomérases relâchent les ADN surenroulés, la gyr
L'état au repos des canaux tensiodépendants par RMN
Les canaux tensiodépendants (CTs) permettent la signalisation dans les cellules via un courant éléctrique. Plusieurs décennies de recherche ont généré beaucoup d'informations sur leurs structures et fonctions, mais l'état au repos de leurs domaines sensibles au voltage (DSV) reste inconnu, puisqu’il