Projets financés

En particulier, nous étudierons systématiquement la dynamique non-stationnaire de tels hétéropolymères longs, topologiquement contraints que sont les chromosomes. Pour pouvoir disséquer les comportements originaux de ces longues chaînes polymériques sur de longues périodes, nous concevrons des métho

La quantification à l’échelle du génome entier des phénomènes moléculaires tels l’expression des gènes ou les mutations de l’ADN, à partir de plusieurs milliers de cellules a révolutionné la biologie à la fin des années 90. Ces avancées ont permis par exemple la caractérisation de sous-types de canc

Les troubles de la production de la parole peuvent entraîner une grave perte d'intelligibilité, rendant difficile la communication des patients avec leur entourage et limitant leur vie professionnelle et / ou sociale. Classiquement, l’évaluation clinique de l’intelligibilité repose sur une évaluatio

L'analyse multifractale permet une étude solidement arrimée à la théorie, effective et robuste pour l'analyse pratique des fluctuations de régularité de la texture des images, qui quantifient leurs structures de dépendances locales et complexes. Cet outil mathématique a permis des succès remarquable

La distribution spatiale de surenroulement le long de génomes bactériens n'est pour l'instant pas accessible expérimentalement. Nous comptons cartographier cette distribution par des méthodes de séquençage haut-débit basées sur l'agent interacalant TMP (tri-méthyl-psoralen). Cette analyse sera condu

L’activation de chaque origine établit deux fourches de réplication divergentes qui accomplissent la synthèse bidirectionnelle de l'ADN avec des vitesses variables. Les fourches peuvent ralentir et marquer des pauses à des sites spécifiques mais la distribution de la vitesse des fourches à chaque ré

Le but de SCAPHE est de développer des méthodes qui facilitent, à partir de données générées par des technologies de séquençage génomique à haut débit, la découverte de combinaisons de SNPs associées à un phénotype donné. L'objectif de ce projet est de permettre la génération de nouvelles hypothèses

Le séquençage à haut débit bouleverse notre vision de l’expression génique par sa capacité à capturer la grande diversité de transcrits produits par chaque cellule. Toutefois, l’analyse bioinformatique de ces données, qui utilise le plus souvent une comparaison à des séquences de référence, échoue à

Dans le cadre du projet MITO-DYNAMICS, nous cherchons à identifier les processus mitochondriaux et leurs régulateurs qui sont responsables de la fonte musculaire (sarcopénie) au cours du vieillissement et dans des conditions pathologiques. Actuellement, nous manquons d'une compréhension quantitative

L'application finale d'un tel modèle sera, à l'aide de mesures de débit obtenues de manière non invasive par IRM, d'évaluer les propriétés biomécaniques du cerveau humain et du singe. Avec ce nouveau modèle, nous comblons le fossé entre les modèles animaux considérés dans les études précliniques et

Objectif A : Nous proposons d'abord de développer de nouvelles méthodes de segmentation d’IRM en s'attaquant aux limites actuelles de l'apprentissage profond (AP). Dans ce projet, nous développerons une nouvelle stratégie d'augmentation des données. De plus, nous proposerons des architectures innova

L'objectif de ce projet est d'introduire une généralisation temps-fréquence des équations rhéologiques (de la dynamque spatio-temporelle) et d'ouvrir la possibilité d'analyser des signaux non stationnaires extraits de systèmes vivants mais aussi de réaliser des expériences sur des cellules et tissus

L'imagerie médicale par rayons X joue un rôle fondamental dans plusieurs domaines de la médecine. Cependant, son utilisation est associée à un risque inhérent d'exposition aux rayonnements ionisants (RI) nocifs pour le patient et les membres du personnel médical. De nombreuses études ont montré que

La microscopie optique 3D est un outil précieux dans de nombreux domaines, en particulier en biologie, grâce à ses propriétés uniques pour l'imagerie de spécimens vivants. Ces dernières années, d'énormes progrès ont été réalisés avec le développement des techniques d’illumination structurée, PALM/ST

Il existe un vaste panel de techniques de microscopie, présentant chacune des spécificités sur le type d’information recueillies sur un échantillon, et des limites sur l’exhaustivité de l’observation. Combiner différentes échelles d'observations et différent types de contenu de microscopie, fonction

SoftwAiR: Traitement haut-débit des données de spectrométrie de masse en temps réel et haute-résolution pour l’analyse de l’air expiré : caractérisation du volatolome en pathologie et dans la réponse aux traitements pharmacologiques La métabolomique est la dernière-née des approches "omiques", co

L'émergence d'un cadre unifié, intégrant les concepts et les connaissances actuelles en écologie et en évolution, constitue un défi majeur pour les décennies à venir. Un tel cadre devrait idéalement être validé expérimentalement, sur un large spectre d'espèces et d'écosystèmes, et offrir des possibi

Le séquençage d’ADN haut débit révèle progressivement les secrets des gènes pour tous les organismes, mais le monde complexe des protéines reste largement méconnu malgré le rôle essentiel qu'elles jouent dans les organismes vivants. Pour une même protéine, il existe une diversité qui provient d’une

Les récepteurs couplés aux protéines G (GPCR) sont des cibles de choix pour les médicaments. En effet, leur caractère membranaire les rend accessibles par voie sanguine, et ces récepteurs sont impliqués dans la majorité des processus cellulaires. De fait, plus de 30% des médicaments actuellement sur

Le but de ce projet est d'identifier les signatures moléculaires des sous-populations de lymphocytes T CD8 mémoire capables de protection, de caractériser les réseaux moléculaires régissant leur génération et de construire un modèle prédictif multi-échelle de ce processus. Les lymphocytes T CD8 mémo

Les maladies cardiovasculaires et autres désordres des vaisseaux augmentent dans le monde, et en particulier en Occident. L'évolution de l'informatique dans les recherches sur les réseaux vasculaires a révélé l'intérêt dans la reconstruction et l'interprétation numériques de ces structures arboresce

L'objectif du projet SINUMER est de construire un simulateur numérique capable de capturer les mécanismes physiques principaux du transport du mucus dans les poumons humains, et l'utiliser pour progresser dans la compréhension de l'asthme sévère et des maladies pulmonaires obstructives chroniques (B

Les interactions protéine-ARN sont cruciales pour de nombreuses fonctions cellulaires et leur implication dans diverses pathologies est étudiée depuis longtemps. La compréhension des mécanismes moléculaires à la base de ces processus reste une question centrale de la recherche actuelle en biologie.