Projets financés
Mécanisme moléculaire de transcription par la polymérase du virus de la grippe – FluTranscript
L'objectif global de FluTranscript est de fournir une description mécanistique détaillée et intégrée de la transcription virale in vitro et dans le contexte cellulaire. Pour atteindre cet objectif ambitieux, les groupes de Cusack et de Naffakh combineront leurs expertises complémentaires en biologie
Etude fonctionnelle et structural des organelles membranaires hébergeant la réplication du virus Chikungunya dans les cellules humaines – TOMOCHIKV
Le programme TOMOCHIKV a pour objectif d'apporter les premières informations fonctionnelles et structurales sur les organelles de réplication du virus Chikungunya (CHIKV). Ces compartiments dérivés de la membrane plasmique fournissent un cadre structurel pour la machinerie de réplication virale, c
Caractérisation, in vitro, de la régulation des moteurs moléculaires et de l’organisation des microtubules par les protéines du transport Intra-flagellaire. – IRMM
Avec ce projet, nous proposons de comprendre comment les protéines de transport intra-flagellaire (IFTs), qui ont récemment émergé comme ayant des fonctions ciliaires et non ciliaires, à différentes étapes du cycle cellulaire, pourraient réguler l'activité et l'organisation des microtubules (MTs) et
DE LA DYNAMIQUE ET DIVERSITÉ STRUCTURALE DES COMPLEXES MEMBRANES DU T6SS VERS LE DÉVELOPPEMENT D’INHIBITEUR DE LA VIRULENCE – T6MeD-OC
Les bactéries pathogènes produisent des facteurs de virulence qui sont responsables de la pathogénicité et qui favorisent la colonisation du patient. Ces déterminants de virulence sont des cibles pharmaceutiques viables. Les médicaments anti-virulence devraient réduire l'utilisation d'antibiotique e
Pili de type IV en action – T4PNanoAction
Ce projet permettra pour la première fois de caractériser finement la dynamique de la machinerie des T4P en action et pourra s’appliquer à d'autres systèmes biologiques. Cette machinerie étant fortement impliquée dans la virulence de nombreux pathogènes bactériens, l’objectif du projet est double. T
Vengeance de phages: analyses structurales et fonctionnelles de protéines anti CRISPR-Cas9 – PHARE
Les protéines anti-CRISPR-Cas9 sont un moyen de défense des bactériophages (phages) contre l'immunité bactérienne CRISPR-Cas9. L’étonnante diversité de séquence des protéines anti-CRISPR-Cas9 identifiées à ce jour et l’absence d’homologues de fonction connue interrogent quant à leurs modes d’action.
Structure et fonctions de la protéine C du virus Nipah – NiPah-C
L'objectif ambitieux du projet Nipah-C est (i) d'obtenir un modèle basé sur la structure pour expliquer les fonctions de NiV C, (ii) de déterminer l'importance de ces fonctions pour la réplication du NiV, l'échappement immunitaire et la pathogénèse et (iii) de mieux comprendre l'interdépendance dans
Base structurale de la détection des lipides dans la fusion virale – LISEFU
Il y a deux objectifs principaux : 1)l'identification des lipides impliqués dans les interactions protéine-membrane dans les cellules 2) Caractérisation structurale des lipides nécessaires à la fusion, soit par co-cristallisation en présence de lipides à chaînes acyles courtes, soit en présence de
Dynamique des transporteurs lysosomaux d’acides aminés – LYSOTRANS
Notre consortium vise à caractériser un transporteur lysosomal impliqué dans le recyclage et la détection de nutriments à l'aide d'approches biochimiques et biophysiques. Le projet est en cours. Ce projet permettra de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans les fonctions métaboliques et de si
Etudes des mécanismes contrôlant l'assemblage de structures fonctionnelles des héparanes sulfates pendant la biosynthèse – GAGOsynth
Dans ce contexte, le but de déchiffrer comment les enzymes biosynthétiques des HS s'associent les unes aux autres pour former des «nanomachines« déterminant l'assemblage de motifs HS spécifiques. Dans ce but, nous exprimerons les enzymes de biosynthèse des HS, analyserons leurs interactions, la stru
Dynamique structurale d'un RCPG dimérique en molécule unique – DynaMuR2
Les objectifs de ce programme, sont de pouvoir enregister les différents changements de conformation du récepteur mGlu2. Ce récepteur est constitué de deux sous-unités, et chacune d'elle est constituée de « domaines structurés principaux: le domaine de liaison, le lien riche en cystéines, et le doma
Etudes structurales et fonctionnelles de moteurs moléculaires membranaires homologues – MeMoX
Le but de ce projet est d’analyser la structure et le fonctionnement des complexes membranaires Tol et Ton qui permettent la transmission d’énergie à travers l'enveloppe des bactéries à Gram négatif. Ces complexes sont impliqués dans l'importation de nutriments, la division cellulaire et le maintien
Reconstitution et activité du complexe méiotique de formation des cassures double brin de l’ADN in vitro – Topobreaks
Mécanisme moléculaire de l’induction de cassures de l’ADN en méiose. La reproduction sexuée est assurée par un cycle cellulaire modifié, la méiose, au cours duquel les cellules diploïdes sont différenciées en cellules haploïdes. Ce cycle cellulaire est composé d’une phase de réplication suivie de
Contrôle traductionnel par des ribosomes spécialisés lors de l’ischémie cardiaque – RIBOCARD
Le contrôle traductionnel de l'expression génique joue un rôle crucial dans la réponse au stress en bloquant la traduction globale, alors que des mécanismes alternatifs stimulent la traduction de certains ARNm impliqués dans la survie cellulaire. Ceci survient dans différentes pathologies telles que
Architecture et fonction de complexes de la biosynthèse de la paroi cellulaire de Pseudomonas aeruginosa – PSEUDO-WALL
Pseudomonas aeruginosa est l’agent causal d’infections nosocomiales graves, ce qui demande le développement urgent de nouveaux traitements. PSEUDO-WALL fait suite au succès obtenu grâce à un financement ANR (qui a pris fin Oct 2017) dans lequel le Partenaire 1 a caractérisé le complexe PBP:MreC, ess
Etude de la dynamique structurale des protéines dans les cellules par spectroscopie RPE – into_the_cell
L’étude structurale des biomolécules in vitro ne peut pas capturer toutes la complexité de l'environnement cellulaire et une information limitée et quelque fois erronée est donc obtenue. Dans la cellule, les protéines fonctionnent et interagissent dans un environnement complexes, dynamiques et sont
Étude de la dynamique structurale d’un canal ionique pentamérique pour la conception rationnelle des médicaments – PENTA_CONTROL
Pentameric ligand-gated ion channels (pLGICs) are transmembrane protein assemblies that mediate neuronal signaling by opening an ion pore in response to the binding of a chemical messenger. Understanding their function at an atomic level of detail is key for the development of drug therapies against
Liaison spécifique de protéines aux gouttelettes lipidiques – MOBIL
Les gouttelettes lipidiques (GLs) sont des organelles essentielles à la régulation du métabolisme énergétique cellulaire. Elles sont faites d’un cœur huileux, composé de lipides neutres, souvent des triglycérides et des esters de stérol, recouvert d’une monocouche phospholipidique et de protéines. L
Rôle des centres Fe-S dans les mécanismes de régulation de la transcription – MANGO-ICING
La transcription génétique est contrôlée, chez tous les organismes, par des facteurs de transcription protéiques (FT) qui reconnaissent et lient spécifiquement des séquences promotrice sur l’ADN. De nombreuses bactéries possèdent des FT contenant des centres fer-soufre (FeS), [4Fe-4S] ou [2Fe-2S], c
Mécanismes moléculaires phospho-dépendants de l’assemblage et de la régulation du divisome bactérien – PhoCellDiv
La division cellulaire des bactéries est un processus fortement régulé, coordonné par un complexe multi-protéique appelé le divisome. L'assemblage du divisome est initié par FtsZ, l'homologue bactérien de la tubuline, qui polymérise pour former un anneau (Z-ring) au site de division. Ensuite, un gra
Mécanisme d’interaction des adenovirus du sous-groupe B2 à la cadhérine desmosomale DSG2 et ses applications – Ad-Cadh
L’étude des adénovirus du sous-groupe B2 est intéressante à deux points de vue. Ils sont, d’une part, responsables d’infections respiratoires parfois fatales nécessitant une surveillance épidémiologique et, d’autre part, ils sont utilisés comme vecteurs oncolytiques dans des essais cliniques de phas
Dynamique structurale des complexes NMD: détecteur et effecteur – DEFineNMD
En utilisant une stratégie de purification rapide de complexes protéiques couplée à la spectrométrie de masse quantitative, nous avons découvert l'existence de deux complexes distincts opérant pour le NMD chez la levure. Ces deux complexes partagent un seul facteur en commun, l'ARN hélicase Upf1, do
Multiplexage des signaux par la GTPase Rac1: une approche quantitative de l’in-vitro à l’in-vivo – MULTIPLEX
Un défi de la biologie moderne est de comprendre comment les circuits de protéines permettent aux cellules de détecter les informations provenant de leur environnement et de prendre des décisions pour y répondre efficacement. Les petites GTPases sont parmi les acteurs les plus importants de la signa
Caractérisation fonctionnelle du complexe KEOPS et son implication dans le syndrome de Galloway-Mowat – KeoGamo
La thréonylcarbamoylation de l’adénine en position 37 des ARNt spécifiques des codons ANN (t6A) est une modification post-transcriptionnelle nécessaire à l'initiation de la traduction ainsi qu’à son efficacité. Cette modification se déroule en deux étapes : la protéine YRDC/Sua5 synthétise d'abord u
Investigation du mécanisme de photo-activation de l'OCP par spectroscopie optique ultrarapide et cristallographie sérielle temps-résolue. – DynOCP
L’Orange Carotenoid Protein (OCP), impliquée dans la photoprotection des cyanobactéries, est une protéine photosensible composée de deux domaines. Sous forte illumination, une translocation de 12 Å du caroténoide a lieu au sein de la protéine, résultant en un changement du spectre d’absorption (fs-n
Stabilisateurs moléculaires des protéines membranaires pour leur étude structurale en solution – CLAMP2
Les protéines membranaires (PMs) représentent 25 à 30% des protéomes. Leur rôle clé dans la signalisation et le transport en font la cible de 70% des médicaments actuels et de 80% des prochains (estimé). Connaître leur structure 3D à l’échelle atomique est nécessaire pour concevoir les meilleurs méd
Dynamique structurale de l'acide gras photodécarboxylase – SNAPsHOTs
L’acide gras photodécarboxylase (FAP) est une photoenzyme récemment découverte et caractérisée par le coordinateur et un partenaire de cette proposition (Sorigué et al. 2017 Science 357:903). La FAP catalyse la décarboxylation des acides gras par la lumière en hydrocarbures et en CO2. Ce n'est que l
Réseau d’interaction du proteasome archéen: vers la démonstration d’un lien entre la fonction du protéasome et le contrôle qualité des ARNs – PROTE-IN
L'accumulation de ribosomes défectueux est induite par le stress et est associée au processus du vieillissement ainsi que à de nombreuses maladies. Comprendre comment les cellules se débarrassent des ribosomes défectueux représente ainsi un défi majeur en biologie fondamentale et en biomédecine. Le