Multidisciplinary approach to stimulate the bioproduction and engineering of Gram+ bacteria’s Extracellular Vesicles (EVs) for therapeutic applications to treat inflammation.

Le but de ce projet est de proposer une biothérapie à base de vésicules extracellulaires (EVs) thérapeutiques comme alternative aux probiotiques vivants. Les EVs seront produites en bioréacteur extrapolable à grande échelle et à haut rendement à partir de bactéries ayant des activités anti-inflammatoires telles que Propionibacterium freudenreichii et Faecalibacterium prausnitzii, l’une industrielle et l’autre originaire du microbiote intestinal. Les EVs seront caractérisées aussi bien au niveau biophysique que moléculaire. Nous procéderons aussi à une ingénierie du contenu des EVs afin d’augmenter l’activité immunomodulatrice intrinsèque de celles-ci. Les propriétés anti-inflammatoires et neuro-modulatrices des EVs seront testées in vitro en modèle cellulaire et in vivo en modèles précliniques d’inflammation aiguë (Maladies Inflammatoires Chroniques de l’Intestin-MICI), à bas bruit (Syndrome de l’Intestin Irritable-SII) associée à des troubles cognitivo-émotionnels et du comportement ou modèle de pathologie neurodégénérative (Alzheimer). Le consortium multidisciplinaire réuni autour de ce projet possède les atouts nécessaires à la bonne réussite de celui-ci en réunissant des expertises de niveau international en microbiologie, en procédés préindustriels de production de biomasse microbienne et de stabilisation/conservation de qualité pharmaceutique, de stimulation physique pour la production d’EVs à haut rendement et approche analytique à haut débit/haute résolution/intelligence artificielle, de chimie pour l’ingénierie chimique et génétique des bactéries/EVs, de pharmacologie de la douleur et d’étude des perturbations du comportement associé et enfin de relation intestin/cerveau et de neurodégénérescence. La synergie entre ces 7 équipes permettra de positionner la France en leader dans le domaine des nouvelles biothérapies à base d’EVs bactériennes.

Le projet a commencé en septembre 2023 par l'organisation du Kick off meeting qui a eu lieu en présence de tous les partenaires à Jouy en Josas et à Paris. Les deux premiéres embauches (1 doc + 1 post doc) à l'unité MICALIS ont eu lieu. Les premiers résultats semblent indiqués que la bactérie Faecalibacterium prausnitzii produit des quantités importantes d'EVs dans un milieu adapté au développement industriel.