Mutualised Digital Spaces for FAIR data in Life and Health Science

Le projet Mutualised Digital Spaces for FAIR Life and Health Sciences (MUDIS4LS) rassemble 39 unités partenaires et 6 infrastructures nationales de biologie-santé (INBS) productrices de données, et s’appuie sur 4 centres de données nationaux et 7 régionaux. 

Il vise à déployer le National Network of Computing Resources (NNCR) opéré par l'Institut Français de Bioinformatique (IFB), et à développer un environnement logiciel permettant aux biologistes de gérer les flux de données biologiques depuis leur production jusqu’à leur diffusion publique, tout en assurant leur sécurisation lors des phases intermédiaires d’analyse et d’exploitation. MuDiS4LS promeut la science ouverte pour rendre leurs données faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables (FAIR). La pertinence du projet est mise à l’épreuve de 5 “implementation studies” (IS), couvrant des problématiques d’intégration et de partage de données : intégration de données d’imagerie, “omiques” et phénotypiques, biologie marine, santé, microbiologie, agriculture. 

Les travaux ont marqué des progrès dans chacun des domaines prévus. Les investissements ont permis de renforcer la puissance du NNCR. En collaboration avec l'Inserm et le CINES, une offre de services a été déployée dans un environnement sécurisé certifié pour l'hébergement de données de santé (HDS),  et la plateforme bioinformatique COVID-19 EMERGEN a été redéployée en HDS.  Le logiciel MassiveFold, développé par l'Université de Lille parallélise l'utilisation du logiciel IA Alphafold (lauréat du prix de chimie Nobel 2024)  sur le serveur HPC Jean Zay (IDRIS), et d'améliorer significativement aux prédictions de structure des protéines. Un effet-levier de MUDIS4LS sur les communautés de biologistes se manifeste par l'engagement de l’IFB dans un projet PPR et de 5 projets PEPR, qui s’appuient sur l’infrastructure numérique financée par le PIA et apportent des financements complémentaires pour des domaines d’application stratégiques.