Institut français de bioinformatique

L’Institut Français de Bioinformatique (IFB) est une infrastructure nationale de recherche qui offre des services en bioinformatique (calcul et stockage, développement et déploiement logiciel, bases de connaissances, gestion de données, accompagnement de projets), organise des formations, et participe à l’innovation méthodologique. Il fédère 21 plateformes-membres, 7 plateformes contributrices et 8 équipes associées, qui couvrent tous les domaines de la bioinformatique et tous les domaines thématiques de la biologie fondamentale et de ses applications (santé, environnement, agronomie). L’IFB est également le nœud français du réseau européen ELIXIR. Les activités de l’IFB sont coordonnées par l’Unité d’appui à la recherche  IFB-core (UAR 3601). 

L’IFB déploie une infrastructure numérique décentralisée (National Network of Computational Resources) qui regroupe 7 clusters et 6 clouds totalisant 20,000 coeurs, 16.5 Po de stockage et 122 TB de RAM, et inclut plus de 800 outils logiciels (packages, appliances, containers) accessibles via différentes interfaces utilisateurs (SSH, Galaxy, Jupyter, RStudio). En 2021, l’IFB a obtenu un financement PIA3 ESR/Equipex+ de 16.5M€ pour le projet Mutualised Digital Spaces for FAIR Life Sciences (MUDIS4LS), qui vise à déployer une infrastructure numérique mutualisée sur l’ensemble des régions, et à orchestrer les flux de données de biologie-santé tout au long de leur cycle de vie. L’IFB s’est activement engagé dans de grands projets nationaux : EMERGEN (surveillance génomique SARS-CoV-2),  ABRomics (recherche et de surveillance concernant l'antibiorésistance). Sur le plan international, l’IFB s’implique depuis plusieurs années sur les aspects sciences ouverte (ELIXIR-CONVERGE), santé (EUCANCAN, B1MG, HERA, ISIDORe, EOSC4Cancer, Genome Data Infrastructure) et environnement (Agro-SERV).  En 2022, dans le cadre du plan Recherche Data Gouv, l’IFB a été labellisé Centre de Référence Thématique pour les données de biologie santé.