MetaGenoPolis

MetaGenoPolis (MGP) explore le microbiote du tractus digestif humain via des méthodes de pointe telles que la métagénomique quantitative et fonctionnelle. Ces approches ont mis à jour le rôle crucial du microbiote dans la santé et la maladie, suscitant ainsi un vif intérêt dans les communautés médicale, académique et industrielle. Les progrès réalisés par MGP dans la compréhension du continuum alimentation/microbiote/santé ont été marquants. Ceux-ci ont ouvert de nouvelles perspectives en matière de prévention, de diagnostic, de pronostic et de traitement des maladies chroniques. Chaque année, MGP continue d'approfondir ses recherches et de renforcer ses collaborations partenariales, consolidant ainsi sa position en tant que leader dans le domaine de l'étude du microbiote intestinal et de ses implications pour la santé humaine. Ceci est notamment illustré par la réalisation de 250 contrats de recherche/prestations (46,7 M€), partagés entre le privé (58%) et le public (42%) sur la période 2012-2023.

En 2023, nos recherches ont donné lieu à 27 publications scientifiques (6 à très haut impact). Nous avons également intégré de grands projets académiques nationaux et européens, tel MicroSPA (dysbiose microbienne dans la spondylarthrite), MicrobAIome (utilisation de données fédérées pour améliorer le screening du cancer colorectal), ou encore le PEPR Holobionte (approches hologénétiques intégratives pour la sélection des animaux de rente). MGP a été aussi activement impliqué dans la rédaction du PEPR SAMS (Système Alimentaire, Microbiote, Santé), et en particulier pour les 4 projets ciblés (soumis à l'ANR en 2023): Cohortes-Microbiomes, Preanalytics, Cloud4SAMS, et Cultissimo. Pour la partie industrielle, nous avons lancé la phase principale du projet de sciences participatives Le French Gut. Nous avons poursuivi notre collaboration avec la start-up Novobiome, et finaliser la nouvelle plateforme de fermenteurs anaérobies, intégrée au Grand Défi Ferment du Futur.