Bases moléculaires de la double fonction des Epromoteurs – ENHPROM

Une question majeure en biologie moléculaire est de comprendre comment la combinaison d’éléments cis-régulateurs proximaux (promoteurs) et distaux (enhancers) régulent finement l’expression des gènes au cours du développement et la différenciation cellulaire. Notre équipe a récemment découvert que certains promoteurs, appelés Epromoters, fonctionnent également comme enhancers pour des gènes distaux. Ce nouveau paradigme soulève la possibilité que des variantes génétiques situées dans les Epromoters puissent avoir des effets pléiotropique sur divers traits physiologiques et pathologiques en impactant différentiellement l’expression de gènes proximaux et distaux. Grace à notre expertise interdisciplinaire, nous utiliserons des approches de biologie synthétique et d'apprentissage profond pour identifier et caractériser les facteurs qui déterminent spécifiquement l'activité promotrice et amplificatrice des Epromoters. Une approche novatrice de gène-rapporteur à haut débit permettra d’évaluer simultanément l'activité promoteur et enhancer de milliers de séquences d'ADN naturelles et synthétiques. Les déterminants génomiques des séquences qui contrôlent l'expression des gènes seront déduits, puis utilisés pour identifier les variants génétiques ayant une fonction pléiotropique et évaluer leur implication sur la santé humaine. Nous proposerons un modèle unifié du fonctionnement des éléments cis-régulateurs afin de mieux prédire l’impact de variants génétiques sur les maladies