Modélisation des structures d'ARN à l'aide des données de sondage chimique – MAGENTA

Les molécules d'ARN sont impliquées dans la plupart des étapes de l'expression génétique. Bien que fondamentale pour la compréhension de leur fonction la détermination expérimentale de la structure 3D des molécules d'ARN reste difficile et le nombre de structures 3D disponibles reste limité.Une méthode expérimentale courante pour étudier les structures de l’ARN est l’utilisation de sondes chimiques telles que les réactifs SHAPE.Malgré le nombre croissant de données SHAPE et des études computationnelles tout-atome, notre compréhension de l'origine chimique de la réactivité des sondes et l’influence de la géométrie locale des nucléotides est encore limité.MAGENTA vise à combler cette lacune en utilisant une approche multi-échelles pour comprendre les éléments structurels clés responsables de cette réactivité chimique.Ces résultats intégrés dans une nouvelle méthode utilisant notamment l'apprentissage automatique afin de biaiser le calcul théorique et de prédire les structures 3D des ARN.