Activités et diversité des rétrotransposons L1 naturels dans les génomes humains – ActiveLINE

La mobilisation des rétrotransposons L1 humains produit des mutations germinales et somatiques lors du développement, du vieillissement et dans certaines pathologies. Une seule sous-famille de L1 (L1HS) est fonctionnelle chez l'Homme, et seules quelques copies sont actives pour un type cellulaire donné, ce qui peut être expliqué par : i) la variation de séquence dans chaque copie de L1 ; ii) la régulation par la position génomique. Nous testerons ces hypothèses sur 12 lignées cellulaires humaines provenant d'individus et de tissus distincts grâce à des essais massivement parallèles pour mesurer les capacités intrinsèques de transcription et de mobilisation de chaque L1HS, y compris ceux absents du génome de référence. Nous évaluerons aussi comment le contexte génomique peut réprimer ou activer les L1, en perturbant la chromatine répressive et en délétant leurs enhancers présumés. Ainsi, ce projet permettra d'étendre nos connaissances sur un puissant élément mutagène du génome humain.