Reassortiments et virus multipartites – Reassort

Les échanges génétiques sont un des mécanismes principaux générant la variabilité intra-populationnelle sur la quelle agit la sélection naturelle. Même s’ils peuvent générer quelques génotypes extrêmement bénéfiques, ils produisent également beaucoup de génotypes délétères ; le bilan exhaustif qui résulterait de l’examen systématique des effets d’échanges génétiques entre deux génotypes est difficile à prévoir et n’est actuellement connu sur aucun organisme. Ce projet ambitionne de combler cette lacune en utilisant comme modèle d’étude les virus multipartites dont le génome est composé de plusieurs segments encapsidés séparément, chaque particule virale ne contenant qu’un seul segment, chaque segment ne codant que pour un seul gène. Les virus multipartites peuvent échanger des segments entiers, un mécanisme d’échange génétique appelé ‘réassortiment’. En utilisant le nanovirus octopartite ‘faba bean necrotic stunt virus’ (FBNSV), un parasite des légumineuses, nous mesurerons plusieurs composantes de la fitness virale de réassortants intra- ou inter-spécifiques pour un seul segment/gène. Ceci nous permettra d’estimer si les réassortiments sont en moyenne bénéfiques ou délétères and si certains gènes/fonctions virales sont plus susceptibles de produire des réassortants bénéfiques. Des expériences de compétition entre réassortants et génotypes parentaux montreront si des mécanismes favorisant l’intégrité génomique des espèces/génotypes viraux sont en action. Par ailleurs, des expériences d’évolution expérimentale établiront si les potentiels effets délétères des réassortiments peuvent être diminués par une coévolution des segments réassortants avec le reste du génome. Enfin, des expériences de transmission chercheront à montrer si les réassortiments peuvent faciliter la transmission des virus multipartites en permettant la transmission indépendante à partir d’individus hôtes différents des différents segments génomiques vers un même individu hôte. Ce projet peut ainsi proposer (i) la première caractérisation systématique de la fitness et des effets biologiques des réassortiments ; (ii) un mécanisme potentiel permettant de diminuer le coût de la transmission inter-hôtes lié au multipartitisme.