Large exploration de la diversité génétique d'espèces de Brassica pour une production durable – BrasExplor

L’identification d’une nouvelle variabilité est indispensable pour répondre aux nouveaux défis de l’agriculture face aux changements climatiques. Les navets et les choux, qui représentent une part importante de la production légumière mondiale, sont originaires du pourtour du bassin méditerranéen. Des populations sauvages et des variétés fermières sont présentes dans des environnements très contrastés. Prenant avantage de ce gradient très large tant pour le climat que pour le sol, les objectifs du projet BrasExplor sont de collecter, d’analyser cette diversité de manière à identifier les déterminants génétiques clés. Pour les variétés locales, les discussions avec les agriculteurs permettront de préciser le système de culture le plus approprié et de développer le marché de niche possible. Lors des récoltes, une description précise de l’environnement sera réalisée ainsi qu’une analyse du sol (nature et microbiome). A partir de 100 populations de choux (Brassica oleracea) et de 100 de navets/navettes (B.rapa), nous établirons la séquence (Next Generation Sequencing) de chaque population afin de rechercher des associations entre du polymorphisme nucléotidique et des variables environnementales ou le sol et sa composition. Cette identification des déterminants génétiques pour l’adaptation aux conditions sub-optimales sera validée en conditions contrôlées de stress hydrique ou thermique et dans les essais au champ en conditions contrastées pour des caractères phénotypiques (germination des graines, architecture racinaire, développement florale, auto-incompatibilité, microbiote composition, morphologie). Ces données génétiques pourront être exploitées pour préciser la structure des populations, le lien entre formes domestiquées et sauvages, l’impact des pratiques agricoles et des contraintes environnementales. Ces résultats seront exploités pour construire des collections-noyaux pour la conservation de la diversité in situ et ex situ avec des méthodes culturales adaptées, pour développer les populations fermières, pour produire les premières populations de prebreeding.